Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr13_0260700
Sequence Length
640 nt
GC Content
0.4563
GUUCUUAUUUUUUCCCUUGUGCUCUCAAGAUGCUGAAUUCAACAGGUAAAUACUGCACUUUUCCCCACACACAAUUACCUUAUAAAUAAACAACAAAAAUACUGGUUCUACCAAGACUACAAUGCUUCUAUGUAAUCUAAAGAGGCAAAAAAAGUUAUUCUUUUUUUUAAAAAAAAAGCAAAAAAGACAUACAACACAUAUUUAUAGAUCUACAUGAGCAGCAACCACCUCUUCUUCUAUCUGCAACAGUGCUUUCGUAUGGAGGCUUACAUCACAUGGCGGUUGGCCGUCCAGAUUUGAAUCUGAGAUAGCAGUCGUUGCAGUACAGUUGGUGGUUUCUGAUCCUGACUUCAGCUCCUGAGGAAGAGCCUCCGAGGUCACACUCACAGGCAACACACUUAAAACAAUGCAAAUGAUAACAAAGACCCAGGGACUCGAUGAUCAUGGCGGCUCCUUUGCCCAGAAUGUUAUUGCAGUAGGAGCAUAUGCGCUUCCCACUGACUGACCUGUUACGCAGCUGAGAGCCUGACUGUGAAGCUGAAGGGGAAUGGCUUCUCGGGGUGGGGGACUGUGUGGUGGCCACACCUGUGGUGGAGGUCUUCACGGAGCCAGCUGAAGGUGGGGGCACGCUGGAGGAGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-178.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -188.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 161.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((..((((((((((....((((..(((.((((((...((((((((..((((((((...........(((((((((..............((((...)))).((((....(((((((...........))))))).....))))..((((((((.............))))))))...........))))))))).....(.((((.(((.....(((((((..((.((.(((.(((.(((((((((((........))).))..(((.....)))((((((((....))))).)))(((.(.(((.((((..((((((((((........((((.((((((...))))))....((((..(((......)))..))))....................................)))).(((((((((.(((...(((......)))....))))))))).))).(((((......)))))))))))))))..)))).)))).))))))))))))..)))))))..)))))))....))).)))).)))))))))..)))))))).....)))))).(((((....))))))))..))))......))))))))))..)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,....,|(((((((,.((((((((((....((((..(((.((((((...((((((((..((((((((.,.........{((((((((..............((((...)))).{{{{....(((((((.,,......,.))))))).....}||}..(((((((({,.......,,,.}))))))}...........))))))))).....,..(({,((,,{{{{(({{{{(..{{.,({((({(({{((({(({,({(,,......},},.,,,(((.,...)))|||(((((....))))).)).|||,,,,||,||||..{||{{|||||,,.|||.,|,||.{{{({{.,{||||||....((((..(((......)))..}))).................{{..,{{{,.....,{.||,,})),||{,,{{|}|||.|}(((,,,.,,||}....,,||||,}}{|||.(((((......))))))}))))}})),,})}}.}})),)}})}))))))).,))))})),,))))})}....))),))))}}))))))))..)))))))).....)))))).(((((....))))))))..))))......))))))))))..))}))))),
Back