Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr13_0260900

Sequence Length

585 nt

GC Content

0.5094

GUCUCUGCGGACUCUGGGCAGAUAACACAAGACACCAUCCUGACUUUUGGACACUGUUCCUCUCCAUUCCUUGGCCCCACAACCCACUCCUGUGUAGCUGGAACCCUGAGCAGUGACCCAUUCACUAUACACACUCUUUGAAGGGAACACACUACAAUUCUUGAAACCUGGAAUCCUAUGGCAGUGAACUUGGAGGGGAGCUCGCUGCAGGUUCAGGGAAAUGCAUGGGAACCCGUGGCCUCCUUAAAAGGCAAGAAAUUUUCUCUCUGAUUUGCUCUCUUACAUUUGAAUCUGAGAUAGCAGUCGUUGCAGUACAGUUGGUGGUUUCUGAUCCUGACUUCAGCUCCUGAGGAAGAGCCUCCGAGGUCACACUCACAGGCAACACACUUAAAACAAUGCAAAUGAUAACAAAGACCCAGGGACUCGAUGAUCAUGGCGGCUCCUUUGCCCAGAAUGUUAUUGCAGUAGGAGCAUAUGCGCUUCCCACUGACUGACCUGUUACGCAGCUGAGAGCCUGACUGUGAAGCUGAAGGGGAAUGGCUUCUCGGGGUGGGGGACUGUGUGGUGGCCACACCUGUGGUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-174.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -183.27

Frequency: 0.0000

Diversity: 138.35

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..(((((.........)))))........((((...(((........)))...)))))((((((((....((((((((((.((((((((((((((((.((..((((((((.(((.(((.((((..............)))))))..)))......(((((........)))))......(((((((.(((......))).)))))))..)))))))).....(((((....)))))((((.......))))...........((((((...((((.(((((.((....)).))))).))))(((((((((........(((((((((((....(((((((.((((........))))....)))))))......)))).))).))))........))).))))))..........))))))..((((((.(((...(((......)))....)))))))))((((.(((((......)).))).)))).....)).))))))))...((((((((..((.(........).))..).))).))))))))))))......))))).))))).....)))).))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(..(((((.........)))))........((((...(((........)))...)))))((((((((....((((((((((.(((((,((((.(.(((((...((((.(((,(((.(((.((({..............}))))))..},)..,...,,((({{{..((({{,..{{{...(((((((.(((......))).)))))))}})}||||||,....(((((....)))))((((.......)))).,{{.....}}}|}||||..((((.(((((.,,....,}.))))).)))){((((((((......,,((((((({(((....(({((((,({((,|,.,,..)}||,|..|||}}}}..,,,.}))),}}).)))}........))),,})))}.........})))),,.}|||,||{((({{,((({{,.{{||,....,,||||,}}((({.(((((......))}})).)))),,})})}})},,,)))}..|,||||}.,.}}})},.)))..))))...})))).).)))))))))......))))).))))).....)))).))))