Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr14_0143800
Sequence Length
526 nt
GC Content
0.4506
UCUAUUGUCUUGAAUGCAUUUGGCCAAGAAAAUUCCAAGGAAAUGAAACAGUUUCGUGAUCCUUUCAAGCUCAUCACUAUCCUGUGGAAAUGGUGCUGUGAACAGUCCACAUGACCUCUGCACAUAAUAUCCAGGAGGUUUCAAUCCACCUCCAAGAUCAACGUGACGAGAUUCAUCAUCUGGAAAAUUAUCAUCACAAAGCCAAGCUCCCAAGUCAGUUCUCUGGAAUUCUGCUGCCACCAGAGCAUAAAACUCUAAUGUGGGUCCCAAGCCAGUUCCUUCUUCUCCUAAAAAUUCAACCUCAAGAACUGAUUUCCGAUCUGCAUGUAUUUGCAUGACAUUCUCAGCCCAUUCCAUCAGUGACUCGCCACGUGGAACUUUUACUCUUUCAUGCUUGAGACGACCAACUCGAAACUCUCCAGGGUCAUCUCGCCUAACACUGCUUGUGGUUCUCGUUCGCUCCACAGUGGCUUCACGUCGGUUCUGUAACCAUACUAUUGCUCUUGAGGCGCCAAAUGCUGUACAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-122.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -132.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 121.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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