Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr14_0144000

Sequence Length

747 nt

GC Content

0.4203

GUUGUUCUUUUGUUAAAUUAAGAAUAUCACUACUUUGAAGAGUAGAAAUGGCCCCCUGGUUUAACCCAGACUUUGUUCCAUGCUCACAAAAAUCCUUAUAUGCAGCUAUGAGCUGAGAACAAUUUCUGUUUUUCCUAAUACUUUUAUUAGUGCCAGUUAAUUUCCAGUGGCGCAGGAAAGCAGCGUCUGCAUUCUUCUGCAGGUAGGUUAUCAAGUCAUUCUUUGGUAAUUCAUCAGUGCCAAGGUACUGCUCCACAUGCUCUAUAGACCAGCAACCCAUUUUUCCAUUUUCCUUUUCUUUAUCAGAAUCCUUCAUUUCUCUGUACAUGAUUGUGUAUGUGGGCUCCCAAAUACGCCUAAGUUUAUCUGAUUUCACAUUGCCAUUACAGGACAAUUGAAGCAAUUUUUGUACAUAGUAAAAGAUGGUUGAUCUGAAAUUGGUGAGUGGUAAUUCAACUUCACGAGUCGUUCCAAGACCUGUUACUUUCAAAGUGAGAGCUAAUCGAGGUGACGGAGUACAUUCGACUUCUUCCAAGAGCUCUGAAUGAGGGGUCCCUGGGGGUGGUAUUUCUAGAUCAGUUGUCUGCUGGACAUUAGUACGACCAGGUCUAGGAUCAAAAGCAGGAACCAAUGCAGAAAACUGUCUCUUUAGCACAUAAUCAUCAUCCCAUGUUCUCCGGCGUCCUCCUUUAGUUUCGUACUCUUCUUCUUCCUGCUCCCCAAUAGGUCGGCUCCCUGCUCCAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-189.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -202.62

Frequency: 0.0000

Diversity: 136.14

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.(((((((..........)))))))..........(((((((((((((((....((((((((...((((..((((((((.(((((......................))))))).))))))..))))......((((((....)))))).((((.(........).))))(((((((.((((...)))).)))..)))).(((.((((((((((......)))))))))).)))(((((....)))))((.......))....))))))))....))))))).((((((.((.((((...(((((...((.((.(((((.((((((.((((((((((.(((....))).)))).................((((.((((((......)).))))))))))))))..)))))).)).))).)).)))))))..))))..)).))))))............(((.(((.......))).)))(((((...))))).(((((((..((((((.(((((.((((..((((((((...((....))....))))))))....((((((((..(((((((((.(((((..((((.....)))))))))..)))))))))......(((........)))......(((......))).........)))))))))))).))))).)).))))..)))))))..))))))))........(((..((....))..)))..)((((....))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.(((((((..........)))))))....,,,,,.(((((((((((((((....((((((((...((((..((((((((.(((((......................))))))).))))))..))))...,,,((((({....})))}|,((((.(........).))))||||||||({((..,||||,,,...,))),|{{.((((((((((......)))))))))).},|(((((....)))))|,......,))....))))))))....))))))}.((((((.((.,((,...,((((,..((.((.(((((.((((((.(({{((((((.(((....))).))))))....,......,,.{((((.((((((......)).)))))))))))}})..)))))).)).))).)).)),,}})}}))))..)).))))))............,{(.(((.......))).|}|{||||,,,}))))}(((((((..((((((.(((((.((((..((((((((.,.{(....}}....})))))))....((((((((..(((((((((.((((({{((((,...,)))))})))..)))))))))......(((........})),{,...,|||,|....,}.........)))))))))))).))))).)).))))..))))))),.}}}}}}}}........(((..{{....))..)))..)((((....))))