Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr14_0144100
Sequence Length
639 nt
GC Content
0.4726
GACAAUUGAAGCAAUUUUUGUACAUAGUAAAAGAUGGUUGAUCUGAAAUUGGUGAGUGGUAAUUCAACUUCACGAGUCGUUCCAAGACCUGUUACUUUCAAAGUGAGAGCUAAUCGAGGUGACGGAGUACAUUCGACUUCUUCCAAGAGCUCUGAAUGAGGGGUCCCUGGGGGUGGUAUUUCUAGAUCAGUUGUCUGCUGGACAUUAGUACGACCAGGUCUAGGAUCAAAAGCAGGAACCAAUGCAGAAAACUGUCUCUUUAGCACAUAAUCAUCAUCCCAUGUUCUCCGGCGUCCUCCUUUAGUUUCGUACUCUUCUUCUUCCUGCUCCCCAAUAGGUCGGCUCCCUGCUCCAGCAGGUACCUGUGGUAGCUGCGAGGUAACAGCAUGAUGCGUUACAUCAGAGCGGGAGCCAGCUCGACGUUGCAGGGAUGGGCGUCUCAGAAUCUCCUCGUAUUCUUGGUCCUCCUGAUUGUCAUCUUCAUUCUCAUCAUCUUCUUCAUCUGGCUCAGGUAAGUCCUCAUCAUCAUCGAGCUCAGCCAAUAGAGUACUGGCACGGCAGCUAUCAAGGAAAUCAUAUAAGGAAUAUUCUGCUUCCUGACCUGUGUCACUCUCACUGGAAGUUGAUGUGAGGCUGGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-176.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -190.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 175.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((..(((.((((((.(((...))))))))).)))(((((...(((((.((((((............(((((((.......)))((.((((((...)))))).))((((..((((((.(((((.((((..((((((((...((....))....))))))))....((((((((..(((((((((.(((((..((((.....)))))))))..)))))))))......(((........)))......(((......))).........)))))))))))).))))).)).))))..))))..))))............)).)))).))))))))))(((((((.((((..((((.((((...)))).))))((.(((((.(((...)))))))).)).))))))))))).((........)).((((.((((.....(((((........)))))..)))))))))))))))....(((.(((((.((((..((((..((((((((((.....)))..........)))).))).....(((((...((((((((((.......((((.((.......))...)))).....))).)).)))))))))).....))))..))))))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((,.,{(,{{{{{|,|,,...|||}}||||{|||{{{{{{,.{(({({((((((....,,..,,,}||{|{|{.......)))||,|||||,....||||,(((((((..((((({.(((((.((((..(((({(((,,,{(...,||....})))))))...,((((((((..(((((((((.(({(({{((((,...,)))))})))..)))))))))......(((........}}),{,...,|||,}....,}.........)))))))))))).))))).}).))))..))))}}}).)}}}.......,,{|{||,,.,,,,,}|||,(((((((.((((..((((.((((...)))).))))((.(((((.(({...}))))))).)).))))))))))).||,....,..))}||||.((({,.|,.(((((,.....,.))))).})})}}))})))))))..,.{((.(((((.((((..((((..{(((((({((,....,}}..........)))).})),{,..{(((,..{((((((({{{....,.{(((,.,,.......},.,.)}})..},,))).})}))))))})))...,}))))..))))))))).)))..
Back