Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr14_0145000
Sequence Length
600 nt
GC Content
0.4833
AACAACAAUUGGUUCAUGGACAUCAGCUCCUGAAACUAUACUGUGUUCCAUUACAAUUUCUGAUCUCCGUUCCGUUUUGGUCGAACCCAAGCUGAUGUCGCUGCUACUGGCCACGCUACACACAGAACUGCUGCUUCCUUUUCUACUUGAGGAGCCUGCAGCAGCAGAUGUCUUGUCUGGACAGUUGUUUUUCACCAAGCUGCUCCAUGAUUGCGUUGUGCCUGAAACAGUGGAUGAAACAGGUUUGGGUGAUGCCACUGUAUCAGGGUCGUACCCUGGUGCAAGCUUGAGGUCAAAUUUUCCUUCUGCGCCCAUACGGUAAGAGUUUGAGCCACCAGCAUCCCAGGUGACAUCAAUCCAGCCAUUGUGUAGUUCUCCUGUGACAGUGCCUUCUCCCUGUGGGCUGCCAUCCUGAUCUCGCCAUUUCCAAUCCAGGCCUCUGAUAACACGAGCUCCUGGAACCAUGUAUUUCAGAACCUGGGAACGUACUAGACGUCUCUGCCGUCUAAGAUUAGCUUCUGCUUCUUUAGCUGCUUUCCCUAGCUGAUCUUCACAUACUCCAUUUACAGUGCCAUAAAGUUCGAAUCCAGAUAAUGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-164.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((..(((((....(((((((.(((..............))))).)))))..)))))..)).)(((((((....(((((((((((.......((.(.(((((.(((.((....((((((((.....(((((((...((((((.....))))))...)))))))..((((((...(((((...((((........((((((((.(((.(..((((.....(((((.(((((((((.(..((....))..).)).))))))).)))))..))))..)))).)).)))))).(((((((((((....(((........)))..))))))))).))..))))...))))).))))))...........))))))))...)).))).))))).).))....(((((((((........................((((((.(((((....)).)))..))))))...((((.((((((...))))))))))..((((((.......))))))(((((((((...(((.....)))..........)))))))))................)))).)))))..))))))..))))).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((..(((((....(((((((.(((.....,........)))))}}))))..)))))..)).)(((((((..,.((((((((((({{{{{{(,,{{((((((,{..,((((({((,....,,{,..(((((((,,,((({{{.....))))))...)))))))|||.|||,,.{{{((((((((({........,,}}))).)))}.}},.))),,}.}||,|..,||||||{|.,..{|}}}}))}|}.|,,}}}}|((({((((({...)))))))}))}.||,,({(({{{,,....,,,,,,||{(({{,,.||..||||}|||||}||{,}}}......}))),}}))},....{.{(((((,{{{.....}|||,}}}}}||||,|,,}.})})))).}},,...||},,},,..........((((((.(((((....)).)))..))))))...{{{{.,,{{{|...})))))}}}}..((((((.......))))))(((((((((...(({.....})}.,........))))))))),,,,...........,,)))).......))))))..))))),}))).)))
Back