Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr14_0145900
Sequence Length
888 nt
GC Content
0.3716
GUUGCAGUGAGCUCAGAUCACGCUAUUACACUCCAGCAUGGGUGACAGAGCAAGACUCUUGUCUUGAAAAAAAAAAAAAGAAAAACCACUUCCCCAAAGACCACUCUGCCCAUCCCCACCUCUCCAGGUCUUGUCCCUGCUUCAUGCUGUCACAGUACCCUGAGCUUUUCCUUCAUGACAUUUAACACAGUUUGUAACCACAUUUUUUCCCCACAAUUAUCUGUUUUCCCUAUUAGACUAUUAGGCACAUAAGGUGCUGUAUUUGUUUUGGUCAUCACCAUAUCUUUCCAAGACCUAACAUAAAGUAGACAAUUUAAAGUUAAAAAACUUGUUCCUGUACAGGUAUUUUUUUACCUUUUAGUGUAAACAUAUCAAAAAAGAUUUUUUUACCACUGUGUUCAAUAACUUUGGAAUCCAGACUCAAAACAAUGUUCCUUGGAUAUCUCUUGAAGGAUACACUAGGAAAUGAUUAACAGUGGUUUCCUCUGGGAAGAGGAACCAAGUAACCAGGAGACAGGAAAGGGAAGACAACGGACUUUUUACUGUAUAUCCUUUUGUGCCCUCAAAAUUAAGUGACAUCAUUAUUUUUUAAAUAAAGCCUACUAGCACCUAAAAGCAUCUUCUGAGAUGCUCAAUUUCCAGAGGACAUAACUUUCAAAUUAUAUUCAGAUUUAGUAGCAAGAUCUAGAAAUGCCCAUAAUACAUAUUUAUAACAUUAAUACAUAUGAUGAUCACCUAUUUUGAUGUGAAUACAAAAUGCUCAUUAGCUAAUAACUCAUAUUACUAUUACUUACUUUUUUUUUUUUUUUUGGAGGCACGGUCUCACUCUGUCACCGAGGCUGGAGUGCAAUGGCACAAUCUUGGUUCACUGCAACCUCCGGCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-225.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -245.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.((((...((((((.(((((((((.(.((((((((((..(((((..((((((.((((((((((((((((..............((((((........................))))))....((((((.(((.....((((((((.((.((((.....((.(((........((((..............................))))........))))).....)))).))...))))))))....(((((((................)))))))....))).))))))(((.....(((((....))))).....)))..(((((......))))).....((((..((((((((((.((........((((((((..(((.....(((((...)))))............(((((.(..(((((......)))))..).))))).)))...)))))))).(((((((((((((((...((((.....((((.((((((((((............)))))).))))...))))))))...)))).......((((....))))..............((......)).......(((((((....)))))))...)))))))))))..................(((((((((.......)))))).)))............(((((.(((.......))).)))))........)).))))))))))..))))....(((....)))(((((.....)))))...........)))))))))))))))).)))))).)))))..)))))))))).).))))))))).))))))...)))).)))))))))))))((..((...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((.((((...((((((.(((((((((.{.((((((((((..(((({,.((((((.((((((((((((((((......((((((...(({....}}}..........,(({....}))|((((((((((.,,..{((((,..}}}},.((({{(....(((((((.({.,,,.{(((((((..((({....{{{{{{,......,....,,{({{,.......,}}},.|{..(((((.....)))))..,,..((({(((,...............}}}))))|.|,|.....||,,{{{.,,.{(((,({{{{{((((((......)))))|...}}}})),))}}.,|}||,,|,..,,,..,}}})))....)))).)))))))},||.....,}|{,((((((,,.,,......,),,..}))))).}}}).)))))))....)))))...,.....,},,|(({{((((((....)))))))))}.,.,..)))).)))))),..))))))...{{((,.......}}}}....,,{((((({,,,(((((((.,.(((((((((({{{,,..,{,,,|..{{......||.......{{{{(((,,,,||||}},..||}|,,}|||},.....,,,.....,,...{((((((((.......)))))).))},||....,,,......,}}},....,,}}.....)))))).)))).,))))))).}.}..})))))}.{{{....||}{((((.....}))}}.,,........)))))))))))))))).)))))).)))))..)))))))))).}.))))))))).))))))...)))).)))))))))))))((..((...))))
Back