Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr15_0375700

Sequence Length

268 nt

GC Content

0.5485

GUCCUGGGAACACUGACCCUGGCAAGAAAACAUUCAUGACUCUGAAGAUCCCCUGUUCCUUGACUGGGGAAACACAUCCCAGUGAAGCUGGUACACACACAGUCAGCUCCUCCUCCAAGUGCCCGUCAAAGUGGGAGGCCAGAACUAGGCUGGAAUGGGAUGGGGUGCCAAAGUGCAGGAGUGGUGACCCGAAUCAGAGCUGGACCCAGUGAAAGGCCUCCCAUUCCUUGAAGUGCUCCUUCAGCCAGUGAGUUGACAGCAGCAGCAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-80.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -85.81

Frequency: 0.0002

Diversity: 30.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((((.......((((((((((..((((((((......)))).......)))).)))).)))))).......)))))).)).((((.(.........((((((((((.....(((.((.(.(((((((((((((((...(((.((((((..(((..((((..((((...........))))..))))..)))...)))).)).)))....)))))))))))..)))).).))..))).....)).))))))))...).))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((.......((((((((((..((((((({......}))).......)))).)))).)))))).......)))))).)).((((.{.........((((((((((.....{((.((.{.(((((((((((((((...(((.((((((..{{(,.(,(({{((((...........)))).}))).,.)),...)))).)).)))....)))))))))))..)))).}.))..))}..,..)).)))))))).,.}.))))..