Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr16_0037400

Sequence Length

378 nt

GC Content

0.4683

GUCUCAAUGUUGGCUCCCACGAUGUAACCCGUGACGUCGAAGUUGAUGCGGAUGAAUUUGCCGAAUCGUGAGGAGUUGUCGUUCUUCACUGUUUUGGCGUUGCCGAAAGCCUCCAGAAUCGGGUUUGCUUGUAGAAGCUGCUUUUCCAGCUCUCCCUAAAAUUCAUUCACAUCUAGUUAUUGGAGAAAGCAACCUAGGUCCUGACAGUUCUACCUUGGAUGGAUGUUGUCACAAAACUCUGCCCUUAACCCACAGGUUCUCUCCUAUCUCCUACCUCCUCUUAGACCCUGAUGCUAAUGUUCAGAUUUACAGGAGGAUUUCAGAAGAGAAGCAACUGUCUGAGCUCUCUAAUAGCUAGGACAUCUGCUCCCUAGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-98.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -106.43

Frequency: 0.0000

Diversity: 72.77

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((((.(((((...((((........))))..))))).))))(((.((((((((((((((((.(((((((((......)))))))).).)))))).((((...((((((........))))))....)))).(((((......))))).......)))))))))).)))((((((((((((((..........(.((..(((((((((.....((.((((.(((.......))))))).))..((((....)))).((((...(((....((((((..((((..((((.((....)))))).)))).)))))).....))).)))))).))))))).)).)))))))))))))))))).(((........)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

((({((((.(((((...((((........))))..))))).))))|((.((((((((((((((((.{((((((({......}))))))).).))))))..,{{...((((((........))))}},},.|,|(,(((((......))))),}.....)))))))))).))}((((((((((((({..........(.((..((((((({{.....((.{(((.(((.......)))}))}.)}...,{{....))}{{(((....(((....((((((..((((..((((.((....)))))).)))).)))))).....)))))))))}.))))))).)),)))))))))))))))))).{((........)))..