Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0039800
Sequence Length
395 nt
GC Content
0.7165
GUGUGGAGGGAGAGGAACGGGAGGGAACCGGAGCUGCACAGGGCGCUUGCGGGCCAGCGCUAGUUCUGGGUGGGCGUCGGCUCGGUGGACCCCGCACUCAGAGCUGCCGGGCAGCCCCGCCAGCCCGGGUAGUGAGGGGCUUAGCACCUGGGCCAGCAGCUGCUGCACUUGAUUUCUCACCGGGCUUUAGCUGCCUCCCCGCGGGGCAGGGCUCGGGACCUGCAGCCUGCCAUGCCUGAGCCUCCCCACCUCCCCGCUAUGGGCUCCUGCGCGGCCCGAGCCUCCCGGACGAGUGCCGCCCCUGCUCCAUGGCGCCCAGUCCCUUCCACCGCCCAAGGGCUGAGGAGUGAGGGCGCACGGCACGGGACUGGCAGGCAGCUCCACCUGCAGCCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-192.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -198.05
Frequency: 0.0001
Diversity: 82.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((......(..(((((((....(((.(((((.((((((.(..(((((((.(.((.(((((((((((((.(((.((...)).))).)).)))))))))))))).))).(((((((..((((((((..((((...))))..))))))))..(((((((..((.(((((....)))..))))..)))))))......))))))).(((((((((....(((...)))....)))))))))..........))))...).)).)))).))))))))..)))))))..)...(((((((((((..((...((((((..((.((((((..(((....))))).)))).))))))))..))..))))...))).)))).)))))))((......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,(((({({{{,.{(..(((((((....(((.(((((.((((((.(..(((((((.(.((.(((((((((((((.(((.((...)).))).)).)))))))))))))).))).(((((((..((((((((..((((...))))..))))))))..(((((((..((.({(((....)))..))))..)))))))......))))))).(((((((((....(({...}))....))))))))).........,)))).,.).)).)))).))))))))..)))))))..|,.,((((({{{,{{,.,,..}||||{{..||,|||||,|,||{...,|||{|.||}|,|,||||||..}}|,,}}}..,))).}}).,)))))))||}},,}},,
Back