Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0078100
Sequence Length
484 nt
GC Content
0.6488
GGGCAAGAAGCAUGGCCACCGAGGCUCCAGCUUAACGGUAUUUGGAGGUCAGCACGGUGCUCACAGAAGCCAGGAACUUGUCCAGGGAGGCGUGCACCGCAGGGGUGAACUCGGCGGGGAGGUGGGCGGCCAGGGUCACCAGCAGGCAGUGGCUUAGGAGCUUGAAGUUGACCGGGUCCACCCGAAGCUUGUGCGCGUGCAGGUCGCUCAGGGCGGACAGCGCGUUGGGCAUGUCGUCCACGUGCGCCACGGCGUUGGUCAGCGCGUCGGCCACCUUCUUGCCGUGGCCCUUAACCUGGGCAGAGCCGUGGCUCAGGUCGAAGUGCGGGAAGUAGGUCUUGGUGGUGGGGAAGGACAGGAACAUCCUCUCCAGGGCCUCCGCACCAUACUCGCCAGCGUGCGCGCCGACCUUACCCCAGGCGGCCUUGACGUUGGUCUUGUCGGCAGGAGACAGCACCAUGGUGGGUUCUCUCUGAGUGCCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-212.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -220.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 139.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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