Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0078400
Sequence Length
385 nt
GC Content
0.6545
GGGCUGGGGGGAGGCCCAAGGGGCAAGAAGCAUGGCCACCGAGGCUCCAGCUUAACGGUAUUUGGAGGUCAGCACGGUGCUCACAGAAGCCAGGAACUUGUCCAGGGAGGCGUGCACCGCAGGGGUGAACUCGGCGGGGAGGUGGGCGGCCAGGGUCACCAGCAGGCAGUGGCUUAGGAGCUUGAAGUUGACCGGGUCCACCCGAAGCUUGUGCGCGUGCAGGUCGCUCAGGGCGGACAGCGCGUUGGGCAUGUCGUCCACGUGCGCCACGGCGUUGGUCAGCGCGUCGGCCACCUUCUUGCCGUGGCCCUUAACCUGGGCAGAGCCGUGGCUCAGGUCGAAGUGCGGGAAGUAGGUCUUGGUGGUGGGGAAGGACAGGAACAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-163.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -170.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 76.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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