Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr16_0401500

Sequence Length

373 nt

GC Content

0.6354

CUCUGAGACACUGGCCACUCCAGUGGCUUCUGGGGUAGAGGGAAAGCCCCACCCACGGAGCGAGACCCCCAUGUGCCACAGCCCAUGGCUCAACAAUGCCUGCUCUCCAUUCCAACCCAGCGACACCAUGGUCUGAGAGCAGCUGAGCGGGUCCUUGACGUGCACACACACAGCCCGUACCUGUACCUGCACUGUCAGGCACCACACAAGUGGGUCCCGCACUGCCUGCCUGCCUGCCCCUCCUACCCCAGGCCUGGGAUGACCUGGAGCCGUGUGCCCCUGAGAAACGCUCCUCUGAGAGGAGAGGCUGCAAAACCUGCUCCCUGCCCUCCACACAGUGCAGAGCGCAGGAGGCGCGGGGUGUUGUCUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-144.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -150.11

Frequency: 0.0000

Diversity: 59.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.((((((.((((((....))))))..((((((((((((..((...((..(((((.(((.(((((.((((.((....)).))))(((((.....((.(((((((....(((..............)))...)))))))))))))).(((.(((((((((((.....((((.......))))...))))).)))))).)))........))))).))).)))..))..)).))..)))).))))))))((((((((....))))).)))))))....)).)))..(.((((((...)))))).))(((((..((..((.(((((((((((.....((((...)))).))))).)))))).)).)).)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.(({(((.((((((....)))))).,((((((((((((..((...,,....(((.(((.(((((.((((.((....)).))))(((((.....(,{(((((((.,..(((..............)))..,)))))))))))))),(((.(((((((((((.....((((.......))))...))))).)))))).))).}....}.))))).))).)))..,,...).))..)))),})))))))|(((((((....))))).)))}|}}....}}.}},..|.((((((...)))))).))(((((..{{..((.(((((((((((.....((((...)))).))))).)))))).)).)).)))))