Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0403500
Sequence Length
366 nt
GC Content
0.5437
CCAGCCACAAUAAGGUAUCUGGGAUUGAGCGCUUAUUUAAAUCGGUAGGCACAUCAAUUUAAAUUUAGGUAGUAGCUCAGCCUGUACCUAACACAUGAGGAAGCCGAGGCGGGAAGAUCGGUUGACUCCAAGAGUUCAAGAGCAUCCUGGGAAUGACAGGGAGACCCCGCCUCUAGAAAAACAUUUAAAAAUUGCUGCGUAUGGUGCCGCACACCAGCAGAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGUGGGAGGAUUGGUUGAGCCUGGGAGUUCAAGCCUUGAGUGAGCUGUGGGUGGGGGGGGCAGCACUGCAGGGUGAGGUGAAGGGGGUGGUUCUGCGGGAGGAGGUGAGGUGGCUCUGCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-115.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -123.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 112.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((.....(.((((((((((((((.(((((((......))))))).).)))))).....))))))).).((((((((.((.(((..(((.......((((((((((((........(((((((...))).))))...(.(((((.......))))).)..)))))))).....................((((...(((((.....)))))))))..((((........))))))))...)))..))))).))))))))((.(.((.(((..((((.(.(..(((.((((((..(....)..)))).)).)))..).).))))...)))..)).).)).....))).).)))(((...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((....{({(((,,(((,((((({((((((({{{{,.|||}}},.,.)),)))},.,,,)))))}.,.}|||}}||||||}}}..,.,..(((..((((((..{.....,.))))))..))}...,.}|,.....,{.(((((.......))))}.,.(((((((((,.,,......,},,.....,.(((((..((.((((.(.{.(({.,....((((((((((((,.{((((((((.(...(((.{{....,),)))...).))),,))))))))),})))).)))))),,).)))).)).))))).},)))))...,)))))}}|||}||}}},,,}}))).).)))(((...)))
Back