Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr16_0403900
Sequence Length
595 nt
GC Content
0.5462
GCUCGGAGAGUGGAAGGGAGGGGCCAGGGCCACAGAGCUAGCACCAGUCAGCCCAUCACACAAGGCUGUCGGGGACCCUAUGUCACUGCGGCCACACCUGGCCCAACCUCAGGGCAGGACCAGCCUAGAAUCCAUCCAAGCUGGGCACCUAAGUCACGCCCAGAUGGGAGAGAAGAGCACAGCACCGUGUACUGAAGAAGCGACUGUGGAUCUCAUCUCAACGGCUCACAUUCCACCCCAAGGAAUCAAAGUGAAACACGGGAAUGACACAAAUACCAACAUGAAAAAUAUCAGAGCACCUGUAACAUUCUUAUUCUUCUUUAUUUGGGACAGGGUCUCACCCUGCGGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUCAUAGCUCACUGCAGCCUCAACCUCCUGGGCUCAAGUGAUCCUUCCUCCCCGCUCAGCCUCCCCAAGUAGCUGAGACCACAGGCGCAUGCAUGCCACCAUGCCUGGCUCAUUUUUUUAUUUUUUGUAGAGAUGCGGUCUCGUCAUGUUACUCAGGCUGGUCUCGCACUCCUGAGCUCAAGUGAUCUACCCACCCCUUCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-199.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 170.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...))))(((((((..(((((((((((.(((.(((((..((.(.(((((..........))))).).))....))).))..))).)))....))))))))...((((((((.((((((((((.((.((..(((...((((((...........))))))...)))..))((.((((......)))).))......(((.((((((.(((((.......(..(((((((((.......)))))....))))..)..(((((((..(((..........(((......))).......)))..)))))))........(((((((((.((((((...)))))).((...((((((.((((.(((.(((....))).))))))).))))))...))..((((((...((.((....))))....))))))....))))))))).))))))))))).)))..(((((....)))))..(((((((((((.((.....)).))))))).))))............)))))))))))).))...)))))).....(((.......))))))))))(((((......)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({{{.|||,(((((((..(((((((((((.(((.(((((..((.(.(((((..........))))).).))....))).))..))).)))}...,)))))))...((((((((.((((((((((.({..,..(({...((((((...........)))))).,})||({{{{((((,(((,,..(({|..{,.....{{{.{{{{((.{{|{{,||,...(..(((((((((.......)))))....))))..}..{(((({(..{{,....,.....(((......}}},.,....})}..}}}))},........,{{{{{(((.((((((...}))))).(({{{((({{(,((((,(((,(((....}},.))))))),))}})),..,,.,}}||||}..{|||,....}},}...,)}}||||,..}}}}})}}},})))|||}}}|,|}|,.{||{{..,,}}))).)))))}.||||||{,,.....}}}||}||}.})))})}.},,,}},})})))))))))).))...)))))).....(((.......}}))))))))||||..,},.,||}},...},}
Back