Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr17_0441600
Sequence Length
240 nt
GC Content
0.5917
GUUCUGGAACUCAACGCUCUCGCCUGCCAGGCCGUCUUCGCCGUAGCGCAGCUGCACCACCUGGUUGAUGGAGUUCCGCACAGUCGCGUCGUACUUCACCAUCACUGACUCCAUGGACUUGAUCAGCCGCCGCUGGAUGUAUCCAGUCUCAGCAGUCUUGACAGCCGUGUCAAUGAGCCCCUCACGACCCCCCAUGGCGUGGAAAAAGAACUCAGUGGGUGUGAGGCCGGCUAGGUAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-76.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -81.85
Frequency: 0.0003
Diversity: 40.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((.....))..))(((.(((((((.((((.((..(((((((((...)))))......((((((((.((((.(((...(((((.((.((........)).)))))))...))))))).))))))))..((((((....))))))....((..((((((((....)))))).))))...(((((.((......)))))))...............)))).))))))))).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((,...,))..))(((.(((((((.((((.{(..(((((((((...)))))......,(((((((.((({{(((...(((((.((.({........}}.)))))))...))))))).)))))))|..((((((,...}})))),.},}}..{,((((((....)))))),|||....{((((.((......))))))}........,,,.,,})))).))))))))).)))).)))
Back