Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr17_0443700
Sequence Length
317 nt
GC Content
0.5584
GUUGGGGUAUACUCUGGGGAGCUGGGACUGUAAGAAGGACUGGUUGGGGUGUACUUGUGGGUGAGGUUGGGCUGUAGCUGGGCGAGCUGGGGCUGUAGCUGGGUGAGCUUGGGGUAUAGGUUGGAGACUGUGGUGUGUAUCGUGGGCUGGAAGGGGAGUAACUUGGUGAGGUCGGGGAAUAGCUGGGUGAUGUUGGAGAGUAGCUUGGAGAGGUUGGGCUGUAGUUAGGGCUGGUAGGUGUGUAGUUGGGACUAGUAGGUGAAUAGCUGGGUGAUGUCGGGCUGUAGCUGGGUGAUGUUGGGGUGUAAUUGGGACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -89.07
Frequency: 0.0001
Diversity: 81.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((....((((((..((......))..)))))))))))))))))...(((..(((((.(((.(((((.(.(.(((((......))))).).).)))..(.(.(((((........))))).).)...((.(.((((....(((......))).....)))).).))((((((.((...(.((.(((.....))).)).)..)).))))))(((((.((((.(.(.((.(.((((((..(((....)))...)))))).)..)).)).)))).))))).........)).))).)))))...))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,...(((((((((((....((((((..((......))..))))))))))))))))).,.(((..(((((.(((.(((((.(.(.(((((.{{{{.,,|||.|.|.||||{(.(.(((((........))))).).),,.|(.(|(|((.,..{{{......)))..,.,)})),},},{(((((.{{,..{.((.(((.....))).)).}.,}).)))))|(((({.((((,{.,,,,.,.{{{{{{..{||,.,.)})...)))))}.},.,}.,).)))).))))).,.}.,.)))).))).)))))...))).
Back