Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr17_0444200
Sequence Length
317 nt
GC Content
0.5521
GUUGGGGUGUAGACUGGAGAGGUUGGGGAAUAAGUAGGAGAUGUUGGGGAGUAUUUUGGGGUGGUGGGUGAAUAGGUGGGACUGGUAGGCGAGUACUUGGGAGAGGUGGGUGAAUAUUUGGGACUGGUAGGUGAGUACUUGGGAGAGGUUGGGGUAUACUCUGGGGAGCUGGGACUGUAAGAAGGACUGGUUGGGGUGUACUUGUGGGUGAGGUUGGGCUGUAGCUGGGCGAGCUGGGGCUGUAGCUGGGUGAGCUUGGGGUAUAGGUUGGAGACUGUGGUGUGUAUCGUGGGCUGGAAGGGGAGUAACUUGGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-70.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -76.14
Frequency: 0.0001
Diversity: 55.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((.((((.((.............(((...(((((((.(..(.(.((((.(((((.(.(.(...(((......)))...).).).))))).)))).).)...).)))))))...)))((((......))))............(((((((((((....((((((..((......))..))))))))))))))))).....(.((.(((.(((.(((((.(.(.(((((......))))).).).))).)).))).))).)).)...)).)))).)))))).))).((.(..(((......)))..).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.((((((.((((.((..,{{......,.(((...(((((((.(..,.{.((((.(((((.(.(.(...(((......)))...).).).))))).)))).,.,...).)))))))...))).,{{..,...,}|||......,.,..(((((((((((....((((((..((......))..))))))))))))))))).....,.{(.({{{(((.(((((.,.,.|||||.}}}}.})})).).}.||||{|.},}.))),)).,...)).)))).)))))).))).((.(..(((......)))..).))
Back