Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr17_0445100

Sequence Length

353 nt

GC Content

0.6062

GAGUGAGAACACCACUGGGCCAGUGAGUUCUAACAGCACAAGUGGAGAACAAGACAAGAGUCUGCAUCAGAAACGGGAUCCAGAAGUUCACCGGGAGCUCUGCCACAAGGCAUUUAUGUACAACGGAGCUGGGCUGGGGGUGACGCCCCGUGAGGGAGGCAAGAACUGCACAGCAGCACGGGCAAGCUGCCCUGGGCCCUAGCCCGCUGCCGCACCCCACGUGCCCUCAGUUCUCCUCGUCACUGUCAUCCGGGCUGAUAGCCGGGCUUGUGAGACUGUAGGUGGGGCUGGUGGGCGAGUAACCAGGGGAAGUGGGAGAGUAGGUUGAGCCUUUGGGGGAGGUGGGCGAGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-134.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -139.94

Frequency: 0.0003

Diversity: 34.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.((....)).)((((.(.(((....(((((....((....))..))))).((((....))))..........(((((.........)).)))....((((.(((.(((((.((.((.(((..(((.((((((((.(((((...((((((((..(..((((.....))).)..)..))))))...)).))))).))))).))))))((.((((.((((((.((((((((((((((((...((.(.((((((.((((...)))).))...)))).).)).))).)))))))).))))).)).....))))..)))).)).))).)).)))))))))).)))).))).).))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.((....)).)((((.(.(({....(((((..{.,{....)),.))))).((((....))))..........(((((.......,.)).)))..,.((((.(((.(((((.({.((.(((..(((.((((((((.((((({.,{{((((((..(..((((.....))).)..)..))))))...),,))))).))))).))))))((.((((.((((((.((((((((((((((((,{{({...((((((.((((...}))).))...))))})},).))).)))))))).))))).)).....))))..)))).)).))).)).}))))))))).)))).))).).))).)