Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr19_0002400
Sequence Length
464 nt
GC Content
0.4978
GUUUUAUAACCUUUCCAUCCUUGACAACACCAAGCACUCUUUCCACUUCAGGGUGUUUGCCUGUGCUGUUCCCUUUGCUUGAAAUGUCCAUGGCCUUUCAUGAAGGUGUGCCUUAAAAAGGGUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGGCCGGGCACGGUGGCUCAAACCUGUAGUCUCAGCCCUUAGGAGGCCGAGAUGGGUGGAGAUCAGGAGGUCGAGACCAUCCUGGCUAACACGGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCGUCAUGGCGGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAGGGCAUGAAGCCGAGAGGCAGAGCUUCCAGUGAGCCGAGGUCGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGGGACAGUGCGAGACUCCGUCUCAAAAUAAAUAAAAAAAUAAAUAAAUAAUUUUUUUUUGGCCGGGCACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-145.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -154.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 176.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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