Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr19_0045000

Sequence Length

1833 nt

GC Content

0.5996

CCGGAGGGUGCUGCAGGAGGAUGUUGAGGGGCCGUGCGUGGCAGGACUGCCGGAAGGAGCAGAAAUGCAGAAAUGGCAGGCGCAAAAGCAGACAGCCAAGAAAGGAGAGAGCAGGAGCCAGGAAGAGGGGGGCUCCUCAGGAAUUAGGUCUGGGCACAGGAGCCCAGGAGCCCUUGCCCCAGGAGCCAGCUGCAGACACAGUCCUCUAUGCACCCCAGGGGCAGUCCUUGCAGAAGGGGUCACCUACUGAGGCCCCGGCCAGGGACCCAGGAUGUAGCCCAAGAGUCUCCCGGGCCUUCUCAACUCCUCUCUCUGCCUCUCAAGGCUCCCCUAGGGAAGCAUGUGGCCCAUGCUGGCCCAAGUCCCUGCCUGCCACGAGGAGAGCCUGGGAGGGGCCCCAGAGUCACGCAAGGAAGCCUUCUCACAGAGGCCAGCCUCUGCUGGCCAUCUAGAGGGUCUCCAGCCCACUCCCUCAGCCUGAGGCCUGGAGGCGAGCCCUCCUUUCCUCCUCCCAGGAGGAGGAGAAGCUGCCAGAACUUGCAUUCGUUCUGGGGCAGCAGAAAAGCAGGAGUGCUUCCCAGCCCCACCUCGCUCCACCCCAGACUCUGCCUGCCCACUUGGCCCUUCCCAGUAGGGGCAUAUCUGGAAAACAUCAGACAAAGUACCAUUAGGUCAGACCCUCACCUUUUGGAGGAGGAGAAUGAUGCCCAGGGCCCAGGCCUGUCCAGAGCAGCCAUGCCCUGUGCACAACCCACACGCGUGAGUCUGCACUCCCAGGCCCUGUCACACCCACAGUGAGGAUAAACACGGGCUGUACCACUGGCACGUCAGCGGGGGACUCUUGCGGCCAGCCUCCUCACACACAUGUGCUCAUGCACAUGCACACACACACACGCACGUGUUACAUGCUGUCUUCCAGAGUCCUCUCUAGGUCUGUCUGCACCCUCAGUCAAGAAUGGAGGUGAAGGGGGGUGGGUUCAACAAGAAGAAGAUCCCUAGAGGAGACUGGGAAGGUCUGAGCUGGCUUCCUCUGUACUCUCUCCCCUUCGCUAGCUUCCCUACCUGGUCUCAAAAGGACUCUGCUCAUUCUUCACUAGACUCUGAGCCUCUCUCUGUGAAGCUGGGCCCUUGAGACCAGUGGUUCUCAUCCUGGGAGGAUUCCAUCCCACUAGGGAACGUCUGACAAUGUCUGGAGGCGUUUUUGGUCAUCAAAACUGGGGGUGGGGGUUUUGCUGCUGGCAUCUUGUAGGUGGAGGCCAGGGAUGCUGCUAAACAUCCUGCCAUGCACAGAACAAUCCCCUACACAGAAUGAUGAGCCCCCAGGGUGAGAAACUGCUUUCAACCAUGAGGCCACGGGGUGGGGCAACCUCUAGAGAAAUACCAGGAGGGGCUGCGGCCAUCCCACUGUGGGGCACCAGAGGCUUGGCACCCCCUCUGCUUCCCACCGCCAUACCACGGGCUCUGCUGCUGACUCUCACAGCACCCCUCCUCACCCUCACCUCCACUCCCUUCCUUCAGCCUGCUCUGCCCUCCCUGGAAGAUCAGGAGGCAAGAAAACAGAUGGGUAAUGCCCCCCGACAGGGGGACAACUGGUGGGAGGCUCACCAGGUGAACUGAGAAGGGGACAAAAAGACUCUGGGCUGCCCUUGCUCUGGGUCAGGAUCCCCCGCACCCAUACCUGCAUCCACAUCGUUGGGCCACCCGCUGGACUGGCUGCUGCCAGCUGCUGGGGAACGGCCUGUCCCGGGAUAGAACACGUCAUCAACAGGGCUCUCCAUCUCACUGUCAUCGAUGGACUUGGGGCGCUUGGUGGUGCUGGUGGAAGGAGGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-765.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -798.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 370.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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