Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr19_0222800
Sequence Length
620 nt
GC Content
0.6081
CAAACGGAGAGGUCGUGUACACACCAGCUGGCUAAAUGCCAUGGUCUGUGACCACGCAGCCUUUUCUAGGUCAUCUCGCUGCCACACCUGCUUUCCCCCUGCAAGAGUCACAGUGACCUCUGGCUGAGGAUAAUGAGGUGGCCCUGACUUUCACUGGGGGAACACUCACGUCGCUGGCCAGCUUCUCGUAGUCCUCCAUCAGGUGCUCGUUCUCUUGGUUGACAGCCAGCACCUUACAGAUCCGGUUGGCGGCAGUUUCAGCCUGGAGGGGAGCACACAGUCAGGGCUGCCUGGGGGCUGGCCACCCUCCCUCCUGACGGGCACGUCCCUUGAAAGCAGCUGGUCCAUGGCCCACGGAACUCCUCACAGAGGGGAAGGAGAGGAAGCACAGCUCCAGUGAGAUGGUGCCCUGUCCCAAUAGGCCUUGUUGGCAUCCUCACUGCUGACUGCAAAAUGCCCCUGGGUCCAGAAAGCCCAGACCCUGGAGGCACCGAGGAGGGUUGGGGAGCCCUCCCACUGCUGCUCGCAAACCCUCUAGUGCCCCACACAGAGGAGGGUGAGGCUGGACGGGUCGGCUGCGUUGGACCUAAGACUGCGGAGGAGUCUCUCCCGGUGGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-258.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -269.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 128.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((((((((((((((((.((((..((((.....)))))))).))))..))))..))))))))..(((((((((((((..((.(.(((.........))).).))..))))..((((.....)))).....))))))))).))..(((((((((((((..((((.(.((((((((((((((((.((((((((.......((((((.((((((.((((((..(((.(((((..........)))..)))))....)))))).))))))))))))......))))))))..))))))))))))(((((......)).)))...((((.......(((((((((((.((((((((....((((((.....((((....(((((..((..(((..(((((.((.(((.((((..(((.....(((.....))).(((((..(((.....)))...((((((.(((((..(.....)..))))).)).))))..))))))))..)))).))).)).)))))..))).))....)))))....)))).....)))))).))).)))))...)))))))))))...))))........)))).))))).)))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....(((((((((((({,(({((((..((((.....)))))))).))))..))))..))))))))((((((....(((.(((..((((({,{((((((.(..(((((((..((.(((((..............))))).))..)))))))..}.))))))}..{{{,,.,...{(((((((((((.((((((((.......((((((.((((((.(((((({.(((.{((((..........))),)}}))).,..)))))).))))))))))))......))))))))..)))))))))))}{((((({(,,({..((((((.....(((..((((((.((((...||||..,,,..((((((...))))))..(((,{((..((,{,,{||,,{{|||..{||||||}.}||,....}|||..,..)))|}}}}},,|||,,...)),...((((((.(((((..(.....}..))))).)).))))..|.((((((((....)))))))),.,.))))))..)))........))))))....,}))))))))))})}..)).))))).))).)))...)))))).,((({,{{{||,,,,)}}|||}}}}},,..
Back