Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr19_0223800
Sequence Length
572 nt
GC Content
0.6294
GGGGGCCCGGUCUGCCAACUCAGCUCCUCUGCUGCAAAAGCGGGGUGCUUGUUGGGGCCAUCUCCUGGCAAUGGCAAGUGAGUCUGGAGCAGAGAGGGGAGAGGGGCUGGGUGGGUCCCCAGCCGUCAGGUGGUGGUGGCGCCCUCUGCUGGCCCCUCGCAUGGCCCAGGCAGUUCCUGGACAAGGCACAUGGGGCUUUGGCCUGGAUUGGGGAGGCCUUGAAGGGACCUCAGAGCAAAGGAAGAGACCUGGGUGUGGUGAGGCAUCCCAGGGCAUGGAAGGGACCGGUUGUGCUGUGGGAAUCCACUGGCCCCUCCUUGGUUAAAAAAGCACAACACAUCAUACAUAUUUACCAGACCAGAAGCGCUGGCCCCAAGUCUCCCCAACCUGGUCGGGGGAACCUCCUGGCCAACCCACAAAGAGAGAGAGGAGAGAGCCUGCCCCAGCCCCUCCCUGCCCACCCACCCACCCCGGAGGACUGCAGAGAGUGCUUUGCAUAGAUACAGAGUGGAGGAAUGGGACUGUGGGGCUGCCCAGGCCCCUCCUGGAGGCCGUCGGGGGUGUUGGGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-243.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -253.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 220.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((.(((..(((..(((((((.((((.....((((.(((((((((..((((.....))))..)))))))).).))))..))))))))))).))).))).)).))))))))).((((.((((.((((....)))).)))).))))((((((.(((((((((((((((((((.........)).))))))...)))))..((((((((((.(((..(((...((((.((..(((......))).(((.((((((((..((((...........)))))).((((((((((((....))))(((((.......)))))....)))))))).............)))))).)))....)).))))))))))))))))))))..((((((((((...))))))))))................(((((.(.(((((...(((((((.(....((((..(..((((.(.(......(((((((....)))))))......).).))))..)..))))...).)))))))..))))).))))))...))))))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({.{{.,((,,({{,{({((((((((.,...}}||||},|||,||||}}|||{.,,,,||||..,|||}}}}..}))||{.||||,|||||{.|||{((((((,,{{{{{|||{(((,.,,||}||||}.}},)))},}},}))))|||||({,({{,(((((,..,,|||}}.}...}}.,.,|||||,..{||||((.((((((((({{(((..(((.(((({..((..{{{......|||,{{||{..||||),,|)))}||,|.,{{..|||.}},((((((((((((....)))){((((.......))))}....))))))))................}||,.||,,..}..))))))))))))))))))))))((((((((((...))))))))))..{{............,||,{,|.|||,|}}}|||||||}}.}}}||||,{({.{((({({{{.{{.{(,(((,(,,.,|||||},......)})}))}}.,,..,|||.|,.,|||}}},}}))))))))))))}.}),)),))))))),}.})))})))
Back