Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr19_0395400

Sequence Length

511 nt

GC Content

0.5636

GUCAGUAGAACUGGGGAGGCUUGAGUCUUGGCCUGGUCAUUUCCAAGGUUCCAAGUUUACUACAAUAGGGGGUUGAUAGGGGUGCUCAGGGGUUGGCCACGAUGGUGUCCUUGAUCCACUUCCGGUAAUGCACCACCUUGGUGUACAGGGAAGGCCUUUCGGGCAGGGCACAUGGUUCACUGCCCCAUGACGUGAUACCUUGAAGCACACCAUUACAGACAAGUGGGCCCCCAGAAUCACCCGAGCAGGUGCUUUUGCCCCCUGUCCAGCGUCCAGCACACAGCAUGAACUUGGUCACCUUCUGAGGGUGAACUUGCGCACACACGUCAUUGGAAAUAACAUGGAGGUCCACACACUGAAGUUUCUUUGGGGUCAAGAACUCCUCUGGUUCAAUGCUGCCCCAGCCUGAGGCGUAGCAGGUGGUCCCCAGUGCUGGCUCCUGGGUGGGCAGGUCCAUGACCUUCACAGCAUCCGUGAGCUCGGCAGGCUCUGACAGGCGGAGCAGCAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-177.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -187.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 164.97

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((......(((...(((((........)))))((......))(((((.(((((((((........(((.(((((((((((.((...((((..(.((((((((((((.(((......(((((.....(((((((...)))))))...)))))(((((......))))).((.(((((((...........)))).))).))))).))))))))........)))).)))))((((.((((......)))).))))))))))))).)))).))).((.....)).)))))))))..))))).(((((((.(((((((.(((.((.......(((..((.(((((.((.((((...(((..(((((.(((((((((.(((((.....)))))..))..)))))))...))))).)))...)))).))))).)).))..))))).))).))))))...).))))))))))......))).((((((..((((((.....)))))).)).))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,(((,.,({{(({(((((,(({,{||,,||||({.({.{(((((({{{{.(((((((({........(((.(((((((((((.((.,.((((..(.((((((((((((.(((.,....(((((.....(((((({...}))))))...)))))((({...|||||||||.,,.{{{{|,|}}}}}......}}},.,}}.),))).))))))))........)))).))))),{{{.((((......)))).))},)))))))))}}))).))).((.....)}.))))))))){{||||,..,|}||||}.,..{,{..,.,.),)},,})))))}.,}.{{{.||.|||{...{|{,,|||||.{{((((({{.{{{||,,...)))))..||,,|}}||}|,,.|}||}.||||,,}}}|.}}))),}||||||{{,{||(((||.(((((...))))).,.}..)))}}},))}|{||||..((((((.....)))))).)).)}))