Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr19_0396100
Sequence Length
766 nt
GC Content
0.5261
UGUCCAGCACAUGUCACUCUCCACUCUCUCAGUGUGGAUCCCACCCCUCUUUCAUCUCUGUACCCCACAAAUAACACAGACACCCCAUCCUAUCUGUGUCCUCAGAGAAAUUGAGUGAUAUGUCUCCAGGCAUGGCCAGUAUUCCCCAGGACACAGAGAGGACAAAAUUACACCAUUUAAGAAACACUCUGGUCUACACCUGUGUCUGCUGAUUUCUUUUCCUAGCAACCCUGGACCUCACACCUAAGGACAAAGGUCAGUAGAACUGGGGAGGCUUGAGUCUUGGCCUGGUCAUUUCCAAGGUUCCAAGUUUACUACAAUAGGGGGUUGAUAGGGGUGCUCAGGGGUUGGCCACGAUGGUGUCCUUGAUCCACUUCCGGUAAUGCACCACCUUGGUGUACAGGGAAGGCCUUUCGGGCAGGGCACAUGGUUCACUGCCCCAUGACGUGAUACCUUGAAGCACACCAUUACAGACAAGUGGGCCCCCAGAAUCACCCUAAGGGUAAAAGCAGGGAGAGAGUGAGAUAGGUCAGUCCCAGUUUCUGCCUGGGCAAUCCUAUCUUUCAGACCUGGACAGGCAGAUAACAGAUAGCAGUUCCCAGCUUUGGAAGAAGAGAGAAAUGUCUCCAGAGCCGACUUCCAGAAGAAGGUGGGCAGGGAUUCCAACAGAGGGGUAGGGGCUCCAGUCCUGGCCGGUGGGGAAGGGACUUCAGGGUCCAGCUCCUGUGCAGAGGGGAGGGUCCACGAGGACAGUCCUUGUAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-267.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -283.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 200.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(.((((((.....(((.(((...((((((.(((.(((((((.........(((((((............(((.((((.((((.((((((((((..(.(((((((.((..((((((....)))))))))))).))))..)))))))))).)))).......................((((.(((((.(.(((...(((((((((..((((((((((..................)).)))).)))))))))))))...))))))))).))))((((((((((......)).)))..)))))............)))))))....)))))))((.((((..(.((((((((((((.(((......(((((.....(((((((...)))))))...)))))(((((......))))).((.(((((((...........)))).))).))))).))))))))........)))).))))).))...((((...)))).....((((.(((((.((.(((......))).)).))))).))))((.((((((.(((((((((.((((((..((............)).))..)))).))))))))).((((......))))....(((.((((........)))).))).))))))))..((.((((((..((((((.((((((..((.....))..))))))...)))))).)))))).)).))))))).))))))))).))).)))....)).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...)))(.((((,,....{(((.,,,.,,||{(((,(((.(((((((...,,{{{{({(((((............{,,.{{{{.((((.((((((((((..(.(((((((.((..((((((....)))))))))))).)))}..)))))))))).)))).......................((((.(((((.{.((,{{.(((((((({,{{(({(((({{......,{,.........}}.}))).}))))))))))))}}.)))}))))).))))((((((((((......))}}))..)))))....,,......))))))}.,},)))))((.((((((((((((.(..(((.((((((..{{{,(((((.....(((((({...}))))))...))))).{{,.,(((.((((((....(((((.(((((((.{{..(,({..{{{{,..,|,|{(({{{.......|||}|{({{,.,,....,{{|,..)))).....((((.(((((.((.(((......))).)).))))).)))){{.,,{||{.(((((((((.(((({,..((............)).,,..)))).))))))))).({((,.....))))....|||.||||,.....},})))})))}))))))))..}}..))))))))))))...)))))).)))),))),.)))))).})}})).)))))))))).)}))))))).))))))|||{|||.,,)}}}})).)))))
Back