Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr1_0008300

Sequence Length

1130 nt

GC Content

0.3973

UUCCAGAGCAGGGCUCGGAAAGUCUCAACCCUGCUCAAAAAGCCCAGUCCAGACUGCCAACCCUUCACCAAGAUAUCGUCCCAGCCUGCCUUUUCAGGUAAAUUUGUCAUUUUUCCUCAAAUGAACCCUACCCGCUAGCCUGGACUCCUCACCCUUCCCUAAACAUACCUGAUAUCUCUGGUAUUUGAGGUUGUUGUUGUUUUUCUGGAAUACUUUCCUCACCAUUUCUACCUAUUAGACCUAUAUUUCAUUAGACCUAAACUCAAAUACUAUGUCCCAUGAUGCCUUUCUUCUCCAACUCAGAACCUUUUCCCUUACCCUUUAGACUCCAGAAUAUGACACUCAACUAUAGGUGAUAAUGAUCACAAUAAUGACAACAAUAAAAACAAAAAGUUAACAGUAUAUACCAUGUGCCAGGCACUCUUCUAGGCAUUGUACAUAACUUGGUUCAUUAAUCCUCACAUCACCCCGAGUUAGGUUCCAUUAUUAUUCCCAUUUUCAUUUUACAGGAAAAGCACUGAGAAUUAGUUGCUCAAGGUCACACAGUCAGUCUGGCUCCCUCAUAGAAACUCAUAAGCACAUCCUGAUGGGCCCCUCACAGCUCUUUUGUAAUUAGUUUCCUUUAGACUAAAGUGGAAAGCUUCUGGAGCUCAAGUAACCAAGCUUCCCAUACCUUUAUAAACCUUCAGAUGCCUCCUGUCAGAUAGAUGCUCAGCAAAAAACCUAUGUUUAAUGAACAGCUACUUUAAACAUAUAAGGAUAAGAAUGCAUCUACCCAAAAGGGUUAAUUCAGCUUAAUUAAUAAUUGGUGAAUGAGAUUUUAAAAGACUAUAUCACUACAACUAUAGUGGGAAUGCCCAAAAGAGGGGUAAAAUGAACUUUCUCAGCCCAGUUGUAUGAAAGCAUCAAGCCAAAUAGAGUCAAUUCACCAAUGAUGUGCUUCAAGAGAAAGCAAUAGACUGAUUUUAAAAAAUAAAAGCUCUAGGUCAUAUGAUUUGUAUUUGCUUAUAGAAAGUAUUUAGUCAAGGCAUACUCCCUCAUCCAAAUAUUCACUCUCCCACUUCCUCUGUGUCUAUUCUGAAGCCACACUCAGCCACUUCCAACAUGGGAUACAACGCAGCCAGCAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-232.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -253.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 201.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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