Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0161800
Sequence Length
491 nt
GC Content
0.5255
GUGGAUCACUUGAGGCCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGGCAACAUGGUGAAAACUGGUCUCCACUAAAAAUACAAAAAUUUAGCCAGGUGUGGUGGCGCAAGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGAAGGCUGAGGUGGGAGGAUGACCUGAGCCCAAGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCACACCAUUGCGCUCCAACCUGGGCGACAGUCACAAGGUAGAUUUUGUUUGAGGCUCUUCCGCUCCUUGAGGGCAAUUUGGUACUAACUUGCAAAAAGCCGGCCAGGUGCUGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCCCUUUGGGAGGCUGAGGCAAGCGGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGACCAACAUGGCAAAACCCCAUCUCUACUAAAAACACAAAAAUUAGCUGGACAUGGUGGCGAUCACCUGUAAUCCCAGCUACUAGGGAUGCUGAGGCACGAGAAUCGCUUGAUAAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-153.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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