Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0346100
Sequence Length
447 nt
GC Content
0.4183
GAUCAGGAUUUCUCCCAAAAUACAACCUCAUUGAGGACCAGCUCCAUGAUGCCCUCUUUCAAAGAAUUUGACAGUUUGAAUUCAAAUAUGCAUUUUAACCUGGAAAAUUGUCAAAGAACUUUAAUUCACUGGAUGGCUUAGAGUGGCUUAGAGCAGUCUUGGUAUUCUGGGACCCUUUCUCACUCCUAGCAAGGCUGAGUGCAAGCUGAAUCCAGCUGAGUACUAAUGAGGCUGCUGUGAUUGCUGAAGUCAAGGCAGGAGGAAGCAUUAAGUAGUCAAUUUUUAGCCUCAUGUUGAGGGCACCUGAUGAACUAACCCUGCAGUCUUUCAAGGUUGAGGUUGACACUCCCUGAUGGCUAUGACUGACUGUUAAAAGACUUUGCUUAAAUUAGGAGUUUCAAAGUUGCUGUUAGUCUAAGAACGCUUAUCCAAACCAAAUCUAGUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-114.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -122.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 75.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((..((((.........((((((((((((((((..((..(((.((((((((..........(((((((((((...((((................)))))))))))))))...((((((.(((((...........))))).))))))((((((((.((...(((((.....)))))....)).))))))))(((((.(((((....)))))..))))).(((((((((...((((((((..(((....((........))))).)))))))).....)))))))))...)))))))..).)))..........)).))).)))))...))))))))......((....))....(((((((.((.....((((((((((.......)))...))))))))).)))))))..))))..))))))((.((........)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((..((((.........(((((((({{(((({,..{|}}{{,,.{((((((..........(((((((((((...{{{{..........,.....}},,))))))))))}...((((((.(((((...........))))).))))))((((((((.((...(((((.....)))))....)).))))))))(((((.(((((....)))))..))))).(((((((((...((((((((..,{{....{{........)),},.)))))))).....)))))))))...))))))},{|||.|.,,,......}.,))},,)))),},))))))))......{{....))....(((((((.((.....((((((({{{.......})),..))))))))).)))))))..))))..))))))((.((........)).))
Back