Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0553300
Sequence Length
203 nt
GC Content
0.4433
GUGUUCAGCUGGGAAGCUUAGGAAUCAUAUUCUACUAGAUCAACUAAGUCAACAAAGACAAAGAAACUGAGUCAUGGGUGGCUAAGUAACUUGCCUAAAACCAAAAUAGCUAAUUAGUGACUUGGGACUCAGGUUUCUGAAAUUCCACAGGCGUGCACUUUCCACUAGACCACAUGGGUGAGGAUGGGGGAUGGUAGGAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-52.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -56.50
Frequency: 0.0015
Diversity: 26.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(..(((((((..((((((((..........(((.....))).(((......))).......(((((((..((((.(((((.((.((................)).)).))))).))))..)))))))))))))))..)))).)))..).))))(((((((((..((.(((........))).))..)))).)))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(..(((((((..((((((((,....,,,..,||,....}},.(((......)))..,,...(((((((..((((.(((((.{,.,{.,..............}),},.))))).))))..)))))))))))))))..)))).)))..).))))(((((((((..((.(((........))).))..)))).))),.})
Back