Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0714200
Sequence Length
595 nt
GC Content
0.4303
GUAGAAAUAUGAAAAAGAAGGAUAACGUUGAUGUCUGAAUAUGUCUUAGCUGCCUUAGUAAAAUGCCCUUUAACCCCCGUCAGUCCCAGUGGCCCACCCACUGCCAGCAGUGGUUUCAUAGCUAUAAAUCCACACUUCCAGCGUCAAGAGGCUAAGACAUCUGCAUAUGAAUAUGAUUCAUCCUACUUAGAAAGUCACUUGCUCUUUCAUACAAUGCAAUCAUAAUACUACGUCAUGCUGUAGUCUUCCGUUUGGGAGCUGUCAGAGUUUAACUAAAAUACAUUUCCAUGAUCACUCCGCGGAGUAGGAUGGCCUUCUGCUUGCCGCAAGAGUGGCCCCCAGCCCCUAGGACUUCACAGGCUGCUUUGGAAAUUGUCAGCUCCUAGCACCAAAGGGUUUAAUCUGAAGAUCAUCAUUAAUGAAGGAGAAAGAUGAGGUUUGCAUACAUGCCCCCUUUCAGUGAGAAAUGUUGGAAUCUGGGGGACAUGAGUAUAUACAGAAAAAGAAAAGCUGGAGGUGUUCUCUUUUUUUGUUGUUUUUUCCCUGAUGGCUUAAUUCAGUGAUAAAUGUACCAUGAUCCCAAGAAACACACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-133.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -147.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((....(((.((((((((((...(((.((...(((((((((((..(((........(((((...((........))...)).)))....((((((....)))))).......(((..((........))..)))...))).)))))))))))...)).)))...))).)).))))).))).(((((((((((.(((((((((..((((..........((((((......))))))(((..((((((((((((.((.................(((((((...((((((.(((((((((((.....)))))))..))))..))))))....(((((..............)))))...))))))))).)))))))))).))..)))(((((.......)))))..)))).))))))))).))).)))(((.((....)).)))..)))))........)))))...))((((((((((((.(((((((((((((((((...(((...)))....))))))))))).......((.((((.........)))).))...)))))))))).))))..........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,,.(((({....{((.(((((,,,{{,.{{{{,,{...{((((((((((,.{{{.{,.....{{..,...,,....,...|,..{{{{{|,....||||||...,},||||.,.....|||,.....,,||.,{,.,|||||,,}}.))))})))))},.,}},||{|||,,,,)),))}}}.}}}.,,,,,(((((,.(((((((((..,(((..,,{.....((((({......}))))),,,..({((((((((((.((..{,.............(((((((.,.{(((((.(((((((((((.....)))))))..))))..)))))}....(((((....,.........)))))...))))))))).)))))))))),{{{...,)}}.......,,.}}}...))}}.))))))))).,)).))){({.{(,...||,}}||||||||,,...,..}}})),,,)}{{||(({{((((.(((({{{((((((((((...((|...}))}},.))))))))))}...,||.{{,((((,........}))).}}...}})))))))).))))..........})))
Back