Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0716500
Sequence Length
365 nt
GC Content
0.4575
GUGUUCCAAAGUCUCAUUUUAAAGAUAAUAACCCAAAUACAGCUUAAGUACUGGCCGUAGCAGAGAAAAGUUCAGCUCCAAAAUAAACUGAGGUUACUUUUUUAAGUAUGAAAAAUAAUUUUGUAGAACAAAAUGUGAAAUCAGCUGGCCAGGCACAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCGGGUGGUUCACAAGGUCAGGAGUUACAGACAAGCCUGGCCAACAAAGUGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGUGUGGUGGCACGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAAACCCUUGAACCCAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-101.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -108.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 65.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.....((((......................(((.(((........))).)))((..((((((((..((((.((........)).))))))))))))..))..((......(((((((...)))))))......))((((((.(((((((.(((.((((((((((...((((((....)))))).....(((((((.(..((((..(((((((.(((...)))...)))))))......))))..)))))))).......................))))))))).).)))))))))).....)))))).(((((....)))))....)))).......)))))(((((....)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.{({,.,.{((((..,,...,|,............{((.(((........))).)}}{(..((((((((..{{((,,,........})})})}))))))))..)},||{......(((((((...)))))))......,}((((((.(((((((.(((.((((((((((...((((({....}))))),....(((((((.(.,((((..(((((((.(({...}))...)))))))......)))),.))))))))...||,............,,,,.))))))))).).)))))))))).....)))))).(((((....))))).,.,}}},..,,}}}),,)){((({....)))).)
Back