Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0718500
Sequence Length
754 nt
GC Content
0.3249
UGAUUAACAGAUAAACUGUGAUAUAUCCAGACCAUGAACUACUACUCAACCAUAAAAAAAAAGCUAAUGAUAUACAAGACAUGGAUGAAUAUUAACAGUAUUAUGCUAUGUAAAAGAAAUCAGCCAUAAAAAAACUAUGUACUGCAUGAUUCCAUUUAUAUGAAAUUCUAGAAAAGCAAAAUUAUAGUAACAGCAGAUAAAGUGGUUGCCAGGGUUAAGGGAUGAGGACUGGGCUGCAAGGGAGAACAAAGGAACCUCUCGGGUUAAUGAAAAUAACCACUAUAUCGUUUUCAGAGUGUUUGUUACACUACUGUGUAUCUCUGGCAAAACUCAUCAAAUUAUGACUUUACAUUGCUUAAUUUUAUUAUGUAAGUUACGACUUAAUAAGGCUCAUUUAAAAAAUAAUCCAUAAUCACAUUUAACUAUGACAACAGCUUUUCAGGAUAGGUAUUUACUACAGACCUUCAAAAAAUAUUAAAAUCAAUAUUAGGAGGGAACUUGUAACCAUAAAGUAGAUAUACAGGAACUAAAAGGUUCUGAGAAUGGAACAGUCCUCAUCCUACUCGACGUGGCCAUGUGGGUAAACAGUAGUUGCCUAGCAACUAAUCUAAACUCUAAAUUUCUAAUAAAUAUAUUGACCACAUAAGCAGGUGAUCUCACAGAUGAUAAACCGCUUUACAUCGAAGGGUUCUUCCUUUAAUAAUAAAAAAUAAUAAUGUGCUUAAGUUAUUUAUCUAAAGUAGGAGUGAACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-145.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -159.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 145.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)(..(((((((((...((((.((..(((((.........(((...................))).........))))).)).))))..))))).))))..((((((((.(.(((((((((((.......))))....)).))))).).)))))))).............((...............)).......((((((((..((((...(((((((((((((..(.....(((((...........))))).(((((.......))))).......((((((((.(((((.....))))).(((((((((((((((((((.((((......)))).))....)))))............((((((..(........((((((((((((((..................)))))..)))).....)))))........)..))))))(((((.(((((....((((((......))))))..)))))...))))).......)).))))))))))(((((....))))))))))))))..)))))))))))))))))...))))))))..((((......(((((((...)))))))......))))...((((((((((((((..((((.(((((((((.(((.(((........)))..)))))))......((((((....)))))).................))))).))))..)))))))......)))))))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.,,,.{({{.....||||....{(((((..,((((,,{{,{{...,,,,,,,.........{{...{(({.......((((((.,.((((({...})))))...)))))).......}))}||,,,,.....,,||||..,{{|.|||||.{,{,,,,}}}...,,,,......},,...,}}}}},....}},,....,)))))}((,{{({{...(((((((((((((..(.....(((((...........))))).(((((.......))))).......(((((((({(((((.....))))).((((((((((((((((({{.((((......}))).}},...}))))............((((((..(..{{,...(((((({{{,,,,...................,}},...))),....,)))))...,,...)..))))))(((((.(((((....((((((......))))))..)))))...))))).......)).)))))))))),((((....))))))))))))))..))))))))))))),}},..}})))))})})))))}..,,,(((((((...)))))))......(((((..,(({...(((((((..((((.(((((((((.(((.(((........)))..)))))))......((((((....)))))).................))))).))))..)))))))...})}).)))))......,
Back