Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0854800
Sequence Length
795 nt
GC Content
0.4189
UAUUCUCUUUCACAUGCUGCUCAACACACAGGCACAGCUGCUUCAUCCACUGCAACUGGGACUGGACAGCAGCACUGUAAGCCUGCAAUAAACAAGCACACAGACAGAAGGGCUUGAGUUUAACAGACUCAAUAUAUAUGCGCAAUACUAUUUUCCAAGUACAACUCUGCUAAUGAUAGAGAAGCCAACAGAAAAGAUGUGGAGAUACUUGACUGGCAUCUGCUCAAUGCUUCCCACGAGUAAGAGGUGUUCCUUUAAUCCAAAAUGGUUUUGUUAGAGGGGGUUACAUAGAAAAGGUCUCUUCCACACUCAGUUGUAAGUAAAUGAUCUAGGCAGCAAAACCCAGGCAUAAAUAAAUUCCUCUGGAAUUCUUCCACUGUUUCUCUUCUUUUGGCAAAGGCACCACACCAACAAGAGUCAAGUCAGGAUCUGUCUGGAUAGUUAUUUGAAGAAAUAUGGUCCAAGUCACUUUUCCUCUGAAAGCUGUGAGCCAAUGCCCCUUCUAUUGUUUCUCUUAGUAGUUUCCUUAGACUAACAAAAAUGUUUGCAGGCUUUUGAGGGACAUAGGAACAGUCAGGAAUGAAAAGAGAGAAGACCCAAGACAAAUGUUCCCUGACACUUCCUCCAAGUCUUUCAGUGGAACAAAGUCUCUAAUUUGAAUACUUUUAUAACAACAACCUCUCAGCAUUUGACCUUCACACAUUCUCAAGUCACACACCUCCACUGUCUGCUUGGCUGGGUGGUUCUCAAGUGAAAGUAGUUCUGCUGUAUCUUGUAGAGAACGAAACACAUCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-184.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -199.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 234.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((....................((((((((((((((...((((.(.(.....).).)))).))))))..)))..)))))......(((((.(.((((.((((.(.((((((((((...)))))))).......)).)...((((((((((........((((((....).))))).((((((((((......((((((.....((((((((((..(((((..((((..((.(((..(((((((..(((((((((((...)))....))))))))(((((..........((......)).......(((((.((........))..)))))..)))))(((((......((((((...))))))..((((((....(((((...((((.............)))).)))))...)))..)))..)))))((((...(((((....)))))..))))....))))))).))))).))))..)))))..)))))..((((((.(((((((.....(((((...(((((..........))))).)))))...)))))))))))))...((((..((((....(((((........((((...((((((((((.((((.....))))...)))).))))))..))))......((((....))))..........)))))..))))))))...............))))).....))))))..)))).))))))(((.....)))..).))))))))))))))))).)))))))))))).)(.........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.{(((((......{({(,,........((((((((((((((...((({.,.{....,),}.)))).))))))..)))..))))).......,,||}}.,{{{.{{||,{.{{((((((({...})))))))......,||,|,..(((((((((,........((((((....).))))).((((((((((......((((((...,,((((((((((..(((((..((((..{{.(({.,((((({{,,((((((({{({...,}}.,.,)))))))){{(({.....,,...((,,,,,,||.......{{{|{.{{......,|}}..|}||}..,,,||{({.,.......||,||,,|))||}|.,|||{((,,,,(((((...((((....,....,.,.}}}}.}))))...}}}.,}}}.,}}}}|||{{...{((({....))))},.)))),.}.))))))).))))).})))..)))))..)))))..{((({,{(((((((,,{{.(({{{,{,(((((..........))))).))))).,,))))))))})))),,}||||}}|{{{....(((((..,.....((((...((((((((((.((((.....))))...)))).))))))..))))......,|{,....}}}}..........)))))..))}}|||}...............))))).....))))))..)))).))))))(((.....)))..}.))))))))),,)))})),,}}))})))))).,|.......,.}
Back