Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr1_0858400

Sequence Length

1255 nt

GC Content

0.4422

CCACCACACCCGGCCUAUUAUUUAUUUCUUUUUUUAGAGAGAGGGAAUUUCACUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGUGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUUGCUGGGAUUACAGGCGCAUGCCACCACACCCAGCUAAUUCUUGUAUUUUUACAAAAUUUCACUAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCUGCCCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCCACUGCGGGUGGCUCCGGCCUAUUAUUUAUAUACUAGCGUUUUCCUCUUACAUUGGUAUCCCACAUACAGGGAUCACAGAAGUAAUCCAGAAAUGAGCUAUCAUCUACUAUAAAGGUAGUGCUAAGAUACAAAACCCCUAACUUACAAAAGGGCUAAGAUGAGAACUCUUGUUUCCAGUGUUCUGUGUUAAACUUGUAUGUUUCCCAUGGAAAGUGUUACAAAAGGUAGCUAUGUUCUACCCACUAUUGAUACUGUAGUUUACUCACGUUAGGGGUUAAAGGAGCUUUUGUUUCCUGGCCUGGGAAUCUAACUACCAAUUGUAACCUUGUUUCAAUGGCGAAAUGUGUUCUGAAUUCCAAAUGAUUUUCCAGUGACUUUCUGGAAUACUCAUUACUGGGGACUGCCUUUACAUUCAAAGAAAUAAAUAAAUCUGGUGGGAUGCUGAAGAUAACCACAGCCUAGAAUUUAUUCUGUUGAUUUUUAAAAAUAAUGACAAUCAUCAAGCACCUUUUGCAGCCAGAUCCUUGUCUGCUCCCUGAGAUCGUCCAAUAAGCUCCUCUCCACGGCGCUUCAAGGCCUCAAAGGAUGGCUGCAGUUUUUCUAGCUCCACGGUGGCACUCUUAUUGUCACUGAUGCACUCUCUGAUCUUGUCUACUUCAGCAGGGAUCAGUGGUGGCAUACGCAGGCGAGAGGAAAGAUUCUCCAGUGUCUCCAACAUAGGCUCAAUUUUAUCAUGAAACUAAACAAAUGUUGGAACAUUACCAUCACAGCAUACCUCAUCACUCUUCUUGGAGAAGUGUUAGGGAAUAAGGACAAGAUAUUAUCCUACUACUGUUUAGGAUAACCUGUGCUCAGUUUAGCCCAAUGGCUAUUAAGUGUUGAGUUUGGUUAAGAAACUGUUUUGGGCCAGGGGUGGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-394.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -417.43

Frequency: 0.0000

Diversity: 409.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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