Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0934700
Sequence Length
1603 nt
GC Content
0.4167
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-554.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -584.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 319.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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