Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0934900
Sequence Length
433 nt
GC Content
0.4527
GUAUGAGCCACAGUGCCUGGCCAGGAUCCUCAAUAAAAUUAUCAGUGAAUUUCUCAGCAGAAACCUUGAAGGGAGUAGGGGAAUAUAUUGAAGGGUUCGAAAAAAACACUGUCAACUGAGAAUUCUGUAUCUGGUAAACUGUCCUUCACAAACAAGAGAGAAAUUAAGAUAUUCCCAGAUAAACAAAAACUGAAUGGUUCAUUACCACUAGACCUACUCUAUAAGAAAUGCUAAAGGGGCUGGGAGCAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUCGGAGGCCAAGGUGGGUGGAUCACGUAAGGUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGUGAGGCAUGGCUGGGCGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-133.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -143.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 82.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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