Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0935100
Sequence Length
409 nt
GC Content
0.4425
GAUCCUCAAUAAAAUUAUCAGUGAAUUUCUCAGCAGAAACCUUGAAGGGAGUAGGGGAAUAUAUUGAAGGGUUCGAAAAAAACACUGUCAACUGAGAAUUCUGUAUCUGGUAAACUGUCCUUCACAAACAAGAGAGAAAUUAAGAUAUUCCCAGAUAAACAAAAACUGAAUGGUUCAUUACCACUAGACCUACUCUAUAAGAAAUGCUAAAGGGGCUGGGAGCAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUCGGAGGCCAAGGUGGGUGGAUCACGUAAGGUCAGGAGUUUGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGUGAGGCAUGGCUGGGCGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -115.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 96.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...........((((((.(((((((.((.....(((...)))..)).))))))).))))))))))))(...........(((...(((.((.....((((((......((.((............)).))......)))))))).)))....))).........((((.....)))).((((.....)))).........((.((((.(((((((.....(((....))).....))))))).)))).)).((((.(((((((.(..((((....(((((((.(((...)))...)))))))......))))..)))))))).((((((...........))))))..(((.((((((((......))))).))))))..((((((....))))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,{{{{,..........,,,,||,,,{{{{,{(({....,(({{...{{(((({{|||||.|,|||||{{{{|{.......,,.,,.},.,.,,,}}}}}}}.(((((((.,,.,{,{{,{{{........},}.},.....,}})}}}.))))))}........|||..((((.....)))).}|}.}))})))).,}}}...}}|}.{(((.(((((((..,..(((....)))..,..))))))).)))).}}.((((.(((((((.(..((((....(((((((.{{(...,}}...)))))))......))))..)))))))).((((((...........))))))||(((,((((({({.....,))})),))))}}..((((({....})))))))))..}
Back