Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_0936100
Sequence Length
409 nt
GC Content
0.4303
GUGUGAGCCAUCGUGCCCAGCCAAGACAGACUUUCAAUACACAGGAAAUGGUGAGUCCCUUAGAGGUUUCUGAGACAUGCUUCUUUGAACACCGAAUGGCAUUAUUUAGCAACACAGCUCUUCUUUCCUGUCUGGCUUGUGGAGGAAGAGAGGAAGCAGAGGCUCUUAUCGCUCAGAAAGCUGAUGACAAUUGCUAGAAAGGCAAUAAAACACCCUGACUCUGCUUAUCUUAGGAACUGUCAGAAGCCUUGAGCUAGAUUACAGUAAUAACUAUAGAAAGCUGAUGAGAAAGUCUUCGUUUUUAAUUUAAACAAUUUGAAAGUUACAUGACCUUUCAUUCUAAGAAUUCAGAGUUCAUGGCCGGGUGCAGUGGCUCAUGUUUUUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-112.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((((((.((((.((.((((((((.....((((((((.((.((((..((((((....))))))..(((((..((((.....)))).)))))..............)))).))))))))))..(((((.(((((.....((((((((((((....((((((((.....))).)))))..((((((.....))))))............)))))))).)))).....)).))).))))).(.((((...(((.(((....))).)))..)))).)...))))))))))((((.......))))....((((((.........))))))......(((((...))))).)))).)))))).)))))))))))(((...((((((....))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(((((((((.((((((.((((.((.{(((((((.....,{,,.....{||{{{,.,((({{{.{{{,|||||..(((((..((((.....)))).)))))..,}}}}.}}}...{((((((((((({.{{...,....}})))})))))))||||.||||{,||||||((((((...(((..(((((.((.(((((.(((((.................))))).))}})).)).)))))..))).))))))....,,,.(((....,}}.......}}})}}}}))})))))},|||{.......}}}}....{((((({{....|}.}))))}{{{|..|,,,..}}))})).)))).)))))).)))))))))})(((...((((({....})))))....)))
Back