Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr1_1014300
Sequence Length
748 nt
GC Content
0.5067
GUCUGCAGCAGAGAUGGAAAAGCUCAUAAAUUAAUAUAAGGGCUUUUGGCCUUGGUUUUCAAAUUCAGACCAGGCAUCAUUGAGCUCCAUGAAAAUCAUCUUUGCGUAUUGUUCAUAGGGUUGCCCAGUAGCUUUAUCUGGGUGCACCACCAGGACAGCCUUCCUGUACACCUUCUUCACCUGCUCUGGUGUUACCAGGUCUGCCAUGCCAACUGGUUUCCACUUGGUCUCCCCAGCCCAUAGUACGGUAUGCAUCGUGGAAAGAAGGGCUCUGAUAUUUCUUUCUUUGCCUUCAAUCCAUUCCAGAAUCUUUAAUUUCUCAGGAUCCAUUUCCUUGGCCAUUUCCUCCUUUCUCAUCUCAGCUAUUGUCCGAGGCCCCUUUUUGUCUUUGUGAGCAUUGAAACCUUGACCAGAGAGUAGGUCUUCAAAAUCAGCUGCUUUUUGUUUCCCUUCCAAAUUACUUGAUCCUUUCCCACGUUCGUUCUGGCCCCCAGGCAUGGCUGAGAAGCUCACGUUGUAGUUGGGUCGGUUCUGGGGAGAGGAGUGGGGCAUGCUGGGCUGAGGCUUAGGCUGUGGCUGCUGCCAGUUGUAGGCACCUCCCUGCUGCCACCCGCCACCCAUAGGCUGGGGAGACGCCUUCUGUGGCGAGCUGAGAGGCGGGAAUCCUCCACCCAAUCCAGUUGGUGUGGUGGGUUUGCUGGCAAAGGAAGAACUACCUAGUGUCCCAAGGUCGGCAAAAGGAUCCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-245.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -259.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 249.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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