Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr20_0092600
Sequence Length
380 nt
GC Content
0.4737
AUUCUUAGUUCUAUUAUUUACAACUGCAUACAUGGUUAAAAUGAUUAAAUCUAGGCCGGGCGUGGUGACUCACUCCUGUAAUCCCAGCACUCUGGGAGGCCAAGACGGGUGAAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCAACACCAGCCUGGCCAACACGUUGAAACCCCGUCUGUAUUAAAAAUACAAAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGUGGAUGCUUGUAAUUCCAGCUACUCGGAAGUCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCAGUAAGCCAAGAUUGCGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGGAGCAAAACUCCAUCUCAAAAAAGAAAAAAAAAAGAUUAAAUCUAGGCUGGGCACAGUGGCUCAAGCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-120.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -125.90
Frequency: 0.0001
Diversity: 43.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((..(((((((..((((........)))).)))))))........((((((((.(((((....((((((....((((((....))))))((((....((((((...)))))).))))))))))....))))))))))))).....((((....((((..((((((...))))))........((((((.(((((((((.(..((((....(((.((..(((((....))))))).))).....(((((...((....))...)))))))))..).))))))))).).))))).)))))))).((((.....)))).(((......))).........))))))...)(((((((((......)))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...,(((((.,(((((((..((((,.......)))).)))))))..,,.,,.((((((((.(((((....((((((,...((((((....)))))){(((....((((((...)))))).))))))))))....))))))))))))).....((((....((({..((((((...))))))........((((((.(((((((((.(..((((...,(((.((..(((((....))))))).))),....(((((...((....))...)))))))))..).))))))))).).))))).,))))))).((((.....)))).{{(......}))........}}}}},,.,,)(((((((((......))))}}))))
Back