Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr20_0113800
Sequence Length
453 nt
GC Content
0.4658
GAAUCCAAUCAUGUCACUGUUUGAAACUAUUCAGUGGCACCACAACCUGAAACCAUUCAAUGGUUUGUAGACUUGGAACAAACAAACCCUUCAGUGGGGGCAUUCAGGGCCUCAAGGAUCUGCAUCUACCUCGGACCCAAACAUCCACAGAAGCCAAGAAGUUAAAAAGGUGUCAGGCUGAUGAAGACAAAGCCAUAAAGCUCAGGGAGCUAGCUCUGUCCUUGGAGCCUGGUACAGAAGCUAUGAUGCACUCCCUUCGGUAAUGAUUCUGAUGCUAACAGCUGACCUUACUGAGUGCUAACCAUGGCCAGGCCUGAGCAGGUACUUCAUAUACAGCUGAUCCUACUUACUAAUUCUAUAUGUGCAAAAUCACCUACUCACUUGAAUUUACUUGCAAAACCAACACUUAAGGGGCUCGCAGACAUGUGCCCGCUACACACAACCCCAGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-107.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -117.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 107.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..........((((((((..((....))..))))))))(((....((((((((((...))))))).)))...)))............)((((((((((((.(((..(((.((..((((.((..(((.....)))..))...))))...)).)))..))))).....(((.(((((.(((((((((.....(((.....(((((((..((((((((((....))))).)))))......((((((..((((((.....(((.......(((.......)))...))).....))))))....))))))....))))))).))).))))))...)))))))))))..................(((((........................))))).............((((((..(((....))))))).))........))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..........((((((((..((....))..)))))))),,,....{(((((((({...})))))).}})..,)))...........,)(((((({((({..,{{.,(((.{{..((((.((..{{{.....))}..)}...})))...}}.}}}..|||{{.....(((.(((({{(((((((((,,...(({.....(((((((,.((((((((({....}))))}})))).,....((((((..((((((.....((({,.,...{{{..,....})),..}},,}}}}))))))....))))))....))))))).))).))))))...)))))))))))..}},,,..,,,,....,{({{{.,,|,..........})}.,,...}))),.............{|((((.,({{....))})))).,}........)))),})))))
Back