Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr21_0025700

Sequence Length

476 nt

GC Content

0.3908

GAAUACUUAGGCAAGAGAAGCAGCUGAACUCCCACGUUCACAUGAAGCAUCCCCCAUCGAUUCUUAAAGCAUAUGUAAAGUAGGACUUAAUUGGGUCACAAACCACAAGAAUAAUAUACAACUGGCUAAGGGGCUAUGUGAUAAAUAAUCAGGAGAGAAUCUAUUCAUGCACUAGUUUGAUACAGCUAAAUUCUUUACAGUACACAAAACCCAUUAAUAAUGUAGUAUAGAGACCAAAAUGUAAAGAGAGAUAGAAUACAUUACUGAUGUGUGGAUUAAUUCAAGUUCAGGCAUCUACUUGUGUUACAGCACAGCUGUCAAAAGGCGAUAAUGAGUAAAUCAUAAAACGGGUUUGUUUCUUCCCACAUUAUUCUAUAAAUGGACACCGAUGGGUAGUGAAGCAAUGGUUUUGCUGUCCAACUUCAGAGGCUGCUGUGGCGGGGGUCUAGUUCUGCAUCUGCUCAAAGAACUUGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-97.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -108.79

Frequency: 0.0000

Diversity: 143.23

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((...((((((((.(((((((.((((((..........((((((..(((....(((((((..............(((........((((((.....))).)))........)))...(((((....)))))(.((((.....)))).).)))))))(((((((......((((...((((((....(((((((((((((((..............))).))))...........)))))))).......((((((.....(((((.((((((......)))))).)))))....)))))).......))))))....))))....)))))))...........)))..))))))...(((((...((((.....((((((((....)))((((((((....))))))))))))).....)))).....))))).)))))).)))..)))).)))..........)))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

,....{({.{(({,({{.,(((((((,(({(((.{(,{((((.,.(((,,{,(((((((.,{({,...{{....}}...{{{{{{..{,,{((((..{((((((.,..........,,,,..(((((....))))),}|{{{.....,}}..,,,,,,.}}|{{((({{{.{{..((({,.,(((({...,(((((((({((((,,..............})),))})...........)))))))),......{{{{{{.....(((((.((((((......)))))).)))))....}||||}...|},,))))))})}}}})),...||||}},..}},,.....,))))))).....)))).}}}}}}}}},...,}}}...))))))){((((((((....))))))))}.,,.......}},)}),})))))))))))).})))})}}).}))})}...,,..,}}}}}}