Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr21_0027300
Sequence Length
409 nt
GC Content
0.5477
GUGUCUCGAGAUACUUGUCAACGGCAUCAGGGGUACUGGCUGCUGUUGUAGGAAGUUUAACAGGAUCUCGGGCAAGAGGUUCCUGGGUAGUCUUGAGUAAACUUUGGGACAUGGCGCUGCCACACACGGCCAUGCAGUACUCUUCUGUGUCAAAGUUGUUCCGGUUGCCGCCACAUCCGCCGUAAAAGAAUGGGGCACACUUCCCUUCAGUCACAUCAAAGUACCAGCGGGAGAUCAUUGCUCGGCACGGCCCCGUCUCGGCUUGUUCAGAGCACACCUCUCGAACCACCUCUUCCACAGACUCUGUGGUGGUGGUGGUGGUGGUGGCAAUGCUGGUGGUUCUCUCUGUGGCUUCUUCGUAGGGUUCCUCAGCCUCUUCCUCUACCUCAUCACCAUCCUCAUCGUCCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -145.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 67.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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