Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr21_0027800
Sequence Length
747 nt
GC Content
0.4752
GUGAUCUGCUCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACAGCGCCAGCCUGAUCACUUCAAGUAAAAAUUCUAAAAAUUCAGAAAUGCACAGUGUAAAAUAAUAGAUGAAUAUAUGCCUAUAUCAAAGGUAUAUGCAUUUACAAGGGAACACAGGUUGAAAUGAAUUUGUGUGUAUUUAUAAAGAAAAUAAAAAGUGUAAUUUUGACAUGAGUGUAGCAGAAAUAUCCUGGCCUAUCUAGGUCCAAAUUCUGAUUUCAUCACUUAACCAGUUAUGUGACCCAGGACAAUUUAUUUUAUUCUUUUUUUGAGACGAAGUUUCGCUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACAAUCUCAGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCUAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGUGUAGCUAGGAUUACAGGCGCAUGCCACCACACCUGGCUAAUUUUUGUAUCUUUAGUACAGAUGGGGUUUCACCGUGUUAGCCAGGAUGGCCUUAAUCUCCUGACCUCGUUAUCCGCCUGCCUCGGCCUCCCAAGGUGCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCCAUUGCGCCCAGCCCAGGCCAAUUAAAAAAAUUUUUUUCGGCCACGCAUGGUGGCCUGUAUUCCCAGCACUUUGUGGGGGGCGGGGGGCGGGGGGCGGGGGGUGCCGCCAAGGUGGGCAGAUCAUGAGGUCAGGAAAUCGAGACCAUCCUGGCUAACAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-281.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -296.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((((.....)).))))))......(((((........))))).((.(((.....))).))...............((((((.(((((............((((((..(((((((((.......))))))))))))))).......(((((((((......)))))))))......................))))).)))))).....))).))))))....(((((((((....))).................((((.(((....))).)))).)))))).....................((((.((.((..(((((.((..(((.((((.(((((((((((((.........)).)))))))..))))))))....))).)))))))..))..)).))))((((((((((((((((((......(((....)))......))))))))................)))))..))))).))))(((((((((((((((((.(((.((.((((((((((((..((((((..(((((.((((((((((((((((((.(((((((....(((((.(((.........((((((..(((....)))..)).)))).)))))))).))))))).))))))))))))).))))).))))))))))).(((((......)))))..(((......))))))))))))))).)).))).)))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((((,..(((({......))))}...(((((.({.((....}}))),))))).........,|,...............((((((.(((((............((((((..(((((((((.......))))))))))))))).......(((((((((......)))))))))...|||.........,,,....))))).))))))..}))))).))))))....,{{((((((....))),},,...,,{{....,,({((.,,...,,},}.)})).,))))).....................{(((.{(.((..(((((.((..(((.((({,(((((((((((((.........)).)))))))..)))))}}},,,.))).)))))))..)).,,}.)))}(((((.{.(((({((((({.,{{{((,....|||{......,)))),....}}}}}}},,},}))))),).))))).))))(((((((((((((((((.(((.((.((((((((((((.(((.(((({(((({,((((((((((((((((((.(((((((....(((({{(((.........((((,{..(((,....})},,}.)))).)))))))).))))))).))))))))))))}.))))),)}}}}|||||,.(((({....,.)))))..}}}}))).))).)))))))))))).)).))).)))))))))))))))))
Back