Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr21_0028100
Sequence Length
486 nt
GC Content
0.3477
UUUCCCUCUCCAGGGAGCAAAUAUUUUGAAGAGCAAGCAUUCCAAGCAAGCAGAAACUCAGCCUUUAAAUCAAACUAAGCUUAAAAGUAAGGUCCUGCCGCACACAGAAGGCAACAGAAAAGUGUCUGAAGAGAUAGCUCCCAUUUUAUAUUUAACAUUUAGAAAUGAGAAAACUGUGUGUGAUUAAUGCUUAUAAUUAGAGGGGGUUAACCCUUAUUUCAAAUAAUGUAGUUCCUGUCUUUCAUUUAAAAUUAUAAAGAUGACUAAAAUGUACAUGAAAGGAAAAUUACAGUUAGGAUCUGCUGUGUUUUAACCCAGAACUGUGGUUUUUUGAAGAAAAUGCUGGAAAAGAUUCUGAUUUGGUAAGAAUAUCUGGAUAUGAGAAUCUUCUAAGAAAGGUGAUUUACCAUUUUCAGGCCAAAGGCAGAGAGUUUCUAACAAUGAUAAAAUUAACAGGCUGUAGGAUCUUCAUUCUCUAAGCUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-99.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -110.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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