Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr2_0149100
Sequence Length
330 nt
GC Content
0.4424
GUCCACAAGUCUUUUUAUCGCAGUUGGCCUCGUCUGAUGCAUCUGCACAGUCUGGAUCCUCGUCACAAACCCACAGCUUGGAAAUGCAAUGCUUCGUAGUCUUACACUGGAAAUAGUCUGGAGAACAGCUGUUUUCAGGACAGUCUCUUUCAUCUUCCUCAUCACCACAGUCAUCUUGCCCAUUACAUCUUAAGUUUACUGGGAUACAUUUCUGGUUCUUGGUACAUUUGAAUUGACCUGACAGGCAGACAUGUGUGUCACAGUUGAGUUCAUCAGAAUUGUCUCCACAAUCAUUCUCUCCAUCACAGAUGAAAGCUGGUAGAGCACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-70.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -77.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 74.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((.((........).).)))......((((.(((.(((((.(((..(((((....))).)).......((((((......))).)))....((.((....((((((((((.(((.....)))))))))))))...)).))(((((((((............((((...((((............))))...))))(((.(((.((((((.............(((((((((.(((((.(((....))).)))))..))).)))))))))))).))).)))....................))))))))))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.{,,(,,,{,........}.,.}))}.....((((.(((.(((((.(((,.{(({{....}}}.,,.......((((((......))).)))..|,{{.{,..,.((((((((((.(((.....)))))))))))))}.,}}.,,{((((((((..,,,,.,{{{{(((({..,,(({{..,,,{{..((((((.((((((((..((....})..)))))))).))))))..}),..|||,,))||}}}.)))}})),,..},}})}..,.,,||||{|||....,}},,...............))))))))))))))))))))))))
Back