Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr2_0150800
Sequence Length
863 nt
GC Content
0.3441
GUUUAUAUAUAUCUAUAAAAGUAAAAUGAAAAAAGUCUGUAAACAUGUAGCAAGGAUUGCCAGACAAAAUAACAGAACACUUAGUUAAAUAUGAAUCUCAGAUAAAUAAUGAAUCAUUUUUAGCAUAAAAGUAUUUUAAAAAUGGGCCAGGCACGGUGGUUUACGCCUGUAAUCCCAGGACUUUGGGAGGCGGAGGCAGGCAGAUCACUUGAGGUCGGUAGUCCAAGAUCAGCCUGGCCGACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUGGCCAGGUGUUGGUGGUGCAUGCCUGUAAUACCAACUACUCAGGAGGCUGAGGCACAAGAAUUGCUUGAGCCCGGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCAGAGAUCGUGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGGGAGAUUCUGUCAUUAAAAAAUAAUAAUGAUAAUAAAUGCAUGAGACAUAUUAAACUUUCUUUAUUGCUUAUCUGAAAUUCAAAUCUAACUGGGUAUCUUGAAUUUUUAUUUGCUAAAUAUGAUAAUCUUAACGUAACUGAAGUGUUUAACUGAGGUUUACUUUAUAGUACAGGAUUAUAUAAUUUUUCGUAAUGGACAUCUCCUUGGAAAUUGGUUAAUUAAACAUUUUAAAUAUAUUUGAGCACCUAAAGUAUAUAUCUCAGUUGAAAAUAUUUUUACAUGUUUUAAGAUCAAUAUGUAAUAUUUAGAAACUAGUUUAAAUAAUAGACCAGCAUUAAAAUGGUCUCUGUUCUCAUUUAUAUUUUAGCCAAAGUUUUAUUCUCAAUAUAUACUAAAUACAGGUGGAUCUGAUCAUAACACACAACUUCCCUCAAUUUUACCAGAUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-207.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -225.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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