Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr2_0150900
Sequence Length
1588 nt
GC Content
0.3923
UACCACAAAUGAAAAUGUAUCCUUGCCAAAUGCUAAUUUAUUUCCUCUGGUGUGAUUCUAUUUUUACAUCAGACUCAAGCAGAUAGUCAAAUUAUCUCAUUUCAUAGGGAAGAAAUUGUAAUAGGUAUCAUUUAAAGGAAAAAAAUUAUUGAGGGGGAUGAGAGGAAAAGGUAAAAGAAAAAAACUUUCAAGGAGAUCAACAAGUAGCUUUCAGCUAGAAGUUCUGAUAUCCUAUACACACCACAUAGAGACAAUAAUAAACUGGUACAGGAAUUGUAUCUGACAGCAUUUCAACAUUAGAGAAUAUGUUAAUGUUAAUAUCUCCACAGGAGUUAGUUUAUUUCAAACCACAAAUGAAAUUUACACAUUUCAGGGCUUGCUAAUUCCAGUGCUUACAAGAGCUAAGUAGGUAACAUAAUGGAACAAGGAUAAAGUUGGGAGUUGGGGAGCUAAGAAAGGCAUGUGUUCCCUAAAAGGCAGCCCAGGUCUCCUUGUUGUCCCUGAGAGACACUAGCCUUGAGGAUGGGGACCCAGCCAUCCCAACAUCCCAGCUGAACUAUUUUUCAUCUUACCUGUCGGGUGAAUGCAGCUAUACAACUCCCGCUGCAUGAGAAUAGCACAAGAACUGCCCAGUCAAUCCACAAAGUCACUAAAUUUUAGAGUAUUUUGUUAUGCAGCAAUGCAUAAAUAAUACUGGGAUUCACAUUUUUCAUCUGGGCCAUUUACAUUCAUCAAAAUCUUAUCAUUGUUUGUUUUUAAAAGGGGGCUAUAACAUGGCAAAGAUUGAGUUUUGCAACUAUAAAUGGUGGUGGAUAUAAAAGAUGAAUUGGAACCUGGGUGAAGGGACACUGAGAGACAAAAAUAAGGCAUCACUACAUGGGUCCAAAGAAGAGAUUAAGAUUUUUAUUUUUAUAUUUUAUUUUAGGCAGGGUCUCGCUCUGUUGCUCAGGCUGGAAUGCAGCUGUGUGAUCAUGGCUCACUGCAUCCUUGACCUCCAGGGCCCAAGCAAUCCUCCUACCUCAGCAUACUGAGUAGCUGGGACUAUAGGCAGGCACCACUAUACCCGACUAAUUUUGUUUGUUUUUUGAGAGAUGGGGUCUCCCUGUGUUGCCCAGGCUUGUCUCGAACUUCCGAGCUCAAACAGUCCUUUCACCUCGGCCUCCCAAAGUGCUAAAAUUACAGCAUAAGCCACUGUACCAGGCCAUAUGACUAUUUAUGCGAGAGCAGGCAUCGGCAAAAUUUUUUCUGCAAAUAGCGAAUCAGUAAAUAUUUUAGGUUUUUCUGGUCAUAAGGUCUCUGUUGCAAACAGUCAGCUCUGCCAUUGUAUCAUGAAAACAGCCACAGAAAAUAUGUAAAUGAGUGAGUACAGCUAUUUUCCAAUAAAACUUUAUUUAUAAAACAGUCAUGGGGUUGUGUCUUUAUUGGCACAAAAGCAGUGGGAAUAAAAAUAGAAGACAACAUUUUGCAGUUAGACUCAAUGUACUGUAGUCAGUGAAGAAAAGGAAACAAUCAACAAUGACUUAUGCUGCAUAUGACCAAGCAGAUGAUACUGGUGGUUACUGAGGCAAGAAAUACAGAGUCAAAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-391.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -427.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 367.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((...(((((.((((((...(((.(((((.(((((((((((((((........)))))))))........(((((((...)))))))........)))))).))))))))...((((((((...((((..((((((..((.((.((((((................((((.....)))).((((.((((((...(((((...)))))...))..)))).))))..............................((((((.....))))))....((((((..(((((........)))))))))))..((.((((...)))).))((..((((((.........))))))..)).....((((((((......(((((((((((((.........))))))).......((((((((((...(.(((((..(((((((((..(........)..))))))))).......))))).).)))))))..)))))).))).....))))))))((((((........))))))...))))))..)).))..))))))..))))..((((..(((.((((((((.((((((((((.((((...(((((((((......(((((((((..(((((.........((((...))))((((((...(((((((....)))))))..)))))).)))))............))))))(((((((((..............((..((.(((((((((..((....))...((((((((.((.((((.(((((((((.......((((((((................(((..((((((((((((((.....(((((((......((((.....(((((((..(((((((.((((.(((((.....................((((.(((((((.((((((..(.(((((.((.(.((.(((((((....))))))))).).)).)).))).)..))))))...))..))))))))).(((((....)))))(((.((((..(((((..........))))))))).)))))))))))).))))))).(((((...)))))))))))))))).....)))))))((.((....)).)).....))))))))))).)))..)))....(((((........)))))...)))))..)))(((((.((((((((....(((....))).((((..(((.((....)).)))..)).))(((((.............)))))...)))))))).)))))..)))))))).).)))))).))))).)))....))))))))).))..))....)))))))))))).......)))))))))..(((((......)))))....))))...))))))))))(((((((((((((...(((.((((..(((...(((((.......)))))...)))..)))).)))..))).))))))))))............(((....))).....))))))).).)))..))))))))))))(((....)))..))))))..)))))...)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........(((...(((((.((((((...{{{.(((({.(((((((((((((((........))))))))),.....,.(((((((...))))))),........))))).)))))}||,,.((((((((...,(((,.((((((..((.((.((((((...,,....{,,....,,,,....})))).((((.((((((...(((((...)))))...))..)))}.))))..............,.............,,({{{({|...})))))),|..{{{{({..(((((........}))))))))))..,,.((((...)))).}}((..((((((.........))))))..))...,,((((((({.,....{((((((((((((.........))))))}.,....}|||(((((((...(.(((((.,(((((((((..{........}..))))))))}...,,..))))).).)))))))|{||}}}}.)}),,,,.}))))))}((((((........)))))),..))))))..)).))..))))))..))))..((((..(((.((((((((.,,,....(((((((((..(((((((((......{.,((((((..{{{{{.{,,{{{..(({,...,)}}{{{|||,},{((((((....))))))}..,}})))}))))}............)))))){{{{{{(((,,,,..........{{..((.(((((((({...{..,,|{{{,{,((((((.((.((((.(((((((((......,((((((((..............,{(({.{(,((((((((((((..{{,({({{{,.....,((,{,..{,...(((((((.,{{{,(((({{((((,.....,)))}}.})))).}}}}.((((((((...|)))))},,..,{{||.(({{((((((((((....)))))),,,.)))))))..).})}...))))))),}..,|||}.(((,{((((....))))))))(((((,.,(((((.((((.(((((.,...,(({.{{,.....,.)))...,,..)).))).)))).)))))).,,)))))..)))}|||(......}})}})),....)))))))))))},))..)}),},.(((((........)))))...))))).,))){((((.((((((((....(((....))}.(({{..(((.{{....}}.)))..}}.)){{{,{.,,,,.....,,.}}}},..,)))))))).))))}..)))))))).).)))))).))))))}))},,.))))))))).)),.))....))}}}}))))))}......)))))))))..,,,,,,{{{{{|,.,,....,,,..,})})}||(((((......)))))}...))))))))).........,.........,}}|(((((...,|....,}})))))|((((.{{..{{...,....,..}}..}}.))))},,.))))))).).)))..)))))))))))).,|.,,,}}...))))))..)))))...)))......
Back