Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr2_0429000
Sequence Length
620 nt
GC Content
0.5194
GUCGCAGUGAGCCAAGAUUGAGCCAUUGUACUCAAGCCUGGGGGACGAGAGCGAGACUUCUUUCAAAAAAAAAAAAAAAGAGUGUAGACUGUAGGCUGGGUGCGGUGGUUCACAUCUUUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGUGGGCAGAUCACGAGGUCAAGAGAACGAGACCAUCCCGGGCAAUAUGGUGAAACCUCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGUUGAGGUAGGAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUUGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGCGACAGAGUGCGACUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGUGUAGACUGUAGCCGGGCAUGGUGGCAUGCAUCUAUAAUCCCAGCUACUCGGGGGGCUGAGGUGAGAGGAUGGCCUGAGUUGGGAGGCAGACGCUGCAGUGAACUGAGAUUGAACCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGCCUGUCUCCAAAAAAAAAGAGUGUACACUGGUCAGGUGUGUUGGUGCAUGCCUAUAAUUCCAGGACUUUGGGACGCCAAGGCAAAAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-229.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -239.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 107.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((.((((....)).))))))))))((..((((((.(..(.(((((((((....))))................((((((.(((.(((((((((((((((((((((........(((((((((((((((....)))))))).(((..((((.(((((..(....)..)))).(((((((......(((((.(((((((((((.................((((((((..((..(((....)))..))..))))))))....))))).)))))).......)))))....)))))))...((((..(((((((.((((....)).))))))))))))).(((((((.((((..(((.(((...(((............)))....))))))..)))).))))))).).))))..)))........((((((((.(((((....))))).....(((....))).)))))))).((((...))))......)))))))))))))))))))).))))))))((.((((...)))).))..........))).))))))....((((((((....))))))))..........).)))).)..).)).))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((((.((((....)).))))))))))((..((((((.(..(,((((,,,,....}}}}}................((((((.(((.(((((((((((((((((((((,{{{{{,.(((((((((((((((....)))))))}.{{{..((((..((((..{....}..)))).(((((((......(((((.(((((((((((.................((((((((,.{(,,({{...,)))..,},.))))))))....)))))}}))))).......)))))....)))))))...((((..(((((((.((((....)).))))))))))))).(((((((.((((..(((,{((...(((............)))....))))))..)))).))))))).,,}}}},.}}).,|.....{((({{{{.{{{||},.,)))))}}..,|||,},.}||.||||}|}}.(({{...))))..}.},))}))}}))))))))))))).)))))))|((.((({...}))).))........,.))).)))))),|,.((((((((....)))))))).....,|||,,.}})),)..).))}})))....))
Back