Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr2_0429100
Sequence Length
2383 nt
GC Content
0.4423
GUUCCUGCCGCCAUGCCCAUCUAACUUUUUUGUAUUUUCAGUAGAGAAAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGAUCUCAGGUGAUCCACCUGCCUCAUCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCACGCCCGGCCAGGAGUAAUCUUUUAUACAACCGGUUCCUUCAAACAAUAAUGAAAUAUUCAUUAGCAACAGAAAUUCACUGCUCCUCCAACACAGUUCUCAAGAUAAUUACUGAUGAUAUGACUCAGCUGAAUCUCACAGGAAUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCUCGCUCUCUCAUUACCUUAAUUAGAUGCCAUCUUCUAAACAACAAACUCUAUAAUUAGUGACCUAAAUAAGUAAAAUGGGCUUGAAAAGAUUUCAAGAAUCAGCUCACCUAACUUACAGGUGAUAAAUGCAACCCACAGAGUAUAUUCUCUUAGUAAUUUUAAUAUUCCUAUCUGUUAACUUUCUUCUGGUACUGUCAUUUAUUUCACUGUUUAGAAUUCUGUUUUCAAAUAUAAUUCUUUGCUUCAAGUAGUACCCUCAAGGCUUUCUAACAUUAAAACUACUGUCUAGACUGGGCACAGUAGCUCUCAGCUGUAGCCCCAACACUUUGGGAGGCUGAGUCAGGAGGAUCGCUUGUGCCUAGGAGUUUGACACCAGCCUGGGCAACAUGGCGAGACCUGUCCCUACAAAAAAAUAUAUAUAUUUUUAAAUUACUACCAGAGGUCACAGUCAAAGAAUCGUACACCGUUUUGGAGCCUACUCCAGUAUAGAUCAAAGCAAAGGCAAGGGCAAUAAGGCUACACCAAGCUGGGGCAGUUUGGGUGGAGAUAGAAAGACAGUAUGAGAGAAACUUAGUAAAAUAUUUUGUCUCCUUCCUCUCCCAGACUCCCCAAACUCUGUCUGUUUAUCUCUUGCUACCAUUAUUCUAACCUUAAGUGUAUCACAUCCUGUGAAAUAGGACUACUAGAAUGGACUACUAGGGUGACAAAGAAUUCCAGUUUAAUUCCAGUUUAUGCUAUGUAUUUCCAUACACCAACUGCAGAGACUAGGUUCUAACUCAAAGUUGUUCUGAAUGUAUUAAAUAUAGGUACAUGCUGAGCCAUUUUAAGUCAUUGAUACUAGUCAUUUAUUUACCUAUUUGAUGCUCCCUUAACUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUUUCGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUCAAUGGCACGAUCUCGGCUCACCGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAUGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUUCCAAGUAGUUGGGAUUACAGGCAUGUGCCACCACGCCCGGCUAAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCUCCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCGAACUCCCGACCUCAGAUGAUCUGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAAUGCUGAGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCGGCCAGAUGCUCCCUUAACUUUUUAAAGCUAGAAACUCAAACAACUACAGCUCUUAGACAUUUUUAAAUGAAAAUAAGUAAGGCUCUACAAUGAGAGCCAGAAAUGUCUGGGUUCCAAUGAUCAGGCAUUUUACCCAAUUGAUAUUGGUCACCUACUUACCAUGACACACAUAAAAUAUACUGUGACAUGUCCGCAGAAGUAUAUUUUACACGUAUCAAAUAACCUGUCCCUAAAUGAUACUUUCAACUCAAAUGUAACACUUUCUUUAUUUGGAAUUCAGUGAUGAGAAGACAACUUGACUAUGUAAGAGACAGUACAGUCCAGCAGUUAAGAGUGUAGACUGGGUCAGGCACAGUGGCUCACGCCUGUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUCCAGACCAGCCUGGACAACAUGGUGAAACCCCAUCCCUACUAAAAAAUACAAAAACCAGCCAGGCGUGAUGGCAGGCGCUUUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCAGAGGCAGGAGAAUCGUUUGAACCCGGCAGGCGGAGGUCGCAGUGAGCCAAGAUUGAGCCAUUGUACUCAAGCCUGGGGGACGAGAGCGAGACUUCUUUCAAAAAAAAAAAAAAAGAGUGUAGACUGUAGGCUGGGUGCGGUGGUUCACAUCUUUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGUGGGCAGAUCACGAGGUCAAGAGAACGAGACCAUCCCGGGCAAUAUGGUGAAACCUCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGGCGUGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCAGGAGGUUGAGGUAGGAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-991.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1027.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 403.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(.((((((((((((((.((((..((((((((((((.((((((((..((((((((((((((((.((.((.((((((((..(((.(((((((..((((((..(((((((...(((((((((((((((((((((.(((..(((((((((.(((((((((.((((.((((............)))).))))......(((((((...)))))))....(((.......))).((((((..((((((.............)))).))...((((((((((...(((((.((.......................................................((..(((.((((...)))).))).))....(((((((((.....(.(((....))).)((((...(((((....(((((((((((...)))))......))))))....))))).))))(((((((((((((...((((..........(((.(((......))).)))..........))))...)))..)).))))))))....)))))))))........................((((..((.......))..))))..(((((((.((....)).))).))))..(((((((((........))))).)))).....)).)))))))))))))))))))))(((((((((((((((...(((....)))))))))).))).)))))(((((..........(((((((....))))))).............)))))((((((........(((..(((((((((((((((((..((..((((..........((((((((.((..((((..........(((((.((((((((.((((((((((........((((.....))))........)))))))))).......)))))))))))))......))))..))..))))))))........))))..))..)))...(((((...)))))...))).)).)))))))))..))).((((.(.((..((((.............(((((..((.((((......))))))..)))))....((((((..((..(((.(((((.((((...(((((((.......)))))))...)))).))))).)))....))..))))))............))))..))).))))..((.((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((.(((((((((((.((((((.(((((((.((.((((((((((.(((((((((.((.(((((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((.(.(((((.((((((.((((..(((((((((((((((((.((.((((((((.((((((((..(((((((((((.(((((((.((((((((.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.(.(((.((((((.(((.(.(((((((..((((((((..................)))).))))((((((.....(((((.((((((.((((((......)))))).(((((((((((..........)))))))))))..(((((....))))).....))))))............((((((((((((((.......)))...)))))))))))...((((((.................)))))))))))....))))))..((((((((......))))...))))............((.((((..(((........))))))).)).))))))).).)))..)).)))).))).).))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))).)))))))).))))))).)))))))))))..)))))))).)))))))).)).))))).))))))))))))...)))).)))))).))))).).)))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).)).))))))))).)))))))))).)).))))))).)))))).))))))).)))).)))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))))).))))))))).)))))))))..))).)))))))))))))))))))))...)))))))..))))))))))))).)))..)))))))).)).)).))))))))))))))))..)))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))).).))(((((((....)))))(((((.((((..........)))).)))))..(((.....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(.((((((((((((((.((((..((((((((((((.((((((((..((((((((((((((((.((.((.((((((((..(((.(((((((..((((((..(((((((...(((((((((((((((((((((.(((..(((((((((.(((((((((.((((.{{((............|||}.}}}}......(((((({...})))))),,,...{.......,)),((((((..{{((((.............)))).})...((((((((({,,.{{{{,.,{||.....................................................{{..{{{.{{{,...}}}|,|||.}}.....|||||,,,.......,,,....|||{|{{{{...{{{({....((((((((((,...}))))}}....,}}|||{{{.,,,,,.))))||{,{{{{{,.||,,.((((......}}}}{((.{{{.,,,,,|,,.,,,..,}|||,..,}||...|||,,}}.}}}}}}},...,}||,}|||{{{.{({{....}}}}.}}}}}}.,||{...||}}}}},,....})}...,{|||{|.,,....}},))}.}})}..(((((((((........))))).))))........}))))))))))))))))))))(((((((((((((((...,,{....}},)))))))},)).)))))(((((.{........(((((((....)))))))...........,.))))){(((((........{({..({{{{(((((({{{{||},|{..{(((..........((((((((..{{{(({(.,,,...||.(((((.((((((((.((((,,((,,{{{{{{.,(({(.....)))}......,.},)))))),)}..}}}})))))))))))))..,,.,)),,,))),,))))))))....,,..}))}..,,..}|||,.(((({...})))}.,}))).}}.}}})))))}..}}},{(((,(,{,..((({{.......,}}}}(((((..((.((((......))))))..)))))..,.((((((..((..(((.(((((.((((.,.(((((((.......))))))).,.)))).))))).)))....))..))))))............,,,}},))),))}}..((,((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((.(((((((((((.((((((.(((((((.((.((((((((((.(((((((((.((.(((((((((((((.((((((((((((((((((((((.((((.(.(((((.((((((.((((..(((((((((((((((((.((.((((((((.((((((((..(((((((((((.(((((((.((((((((.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.(.(((.((((((.(((.(.(((((((.,,,,,{(((.{............,,..}}}|,|||||(((({{,...,|,,,.|,,{{,.((((((......)))))).(((((((((((.,.,....,,)))))))))))..{((((....))))).....},}}},...{{,......((((((((((((((.......}))}..,))))))))))...((((({.................})))))..,,..,,,,,,,|,..,,,{{(({.,,,,,))},..,})}}.})}},,}....{|,{{{,.,{||.,.,,,..}},}))).}}.))))))).).)))..))})})).))).).))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))).)))))))).))))))).)))))))))))..)))))))).)))))))).)).))))))))))))))))))...)))).)))))).))))).).)))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).)).))))))))).)))))))))).)).))))))).)))))).))))))).)))).)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))},,,)))))).))))))))).)))))))))..))).)))))))))))))))))))))...)))))))..))))))))))))).)))..)))))))).)).)).))))))))))))))))..)))))))).)))))))))))))))).)))))))))))))).).))((,{.,({({.|||.,{({{{.((((.{{{{.....,,}}}))),)}}}}}))},,}},))
Back